>AFRP1   A.formosa repetitive sequence.
gatcgacaagttttggtggtttttcagccaatgccatactttttgcaacatttttctaaaaattgggtca
aaaccctagtgcacggtactttgcacaaaaagttgcttatctcgagga
>AGRP1   Mosquito repetitive sequence.
ctcgagcaaaccagagaggcgtacggaccgacacgaaagttttaccaagcgatacgaggtcaccgaaaca
acgttgtacctaaggtaacctgctgtcgcaacaaggatgaagatctggttagtaaccatccagaggtcct
cttgcgatgggctcagtactttgatgaattactcaacgactagttcaacgagcagctagaagcgcactag
ccgatagtgtcatgcactgccacctagaggaaacacaaaggcataccgtcggctgaaaaatccaccggca
cccggaaccgaccggaattgcagcgaactggtcaagaatggaggtgcacgacgtagaaaacgaagtaatc
atcattactgaggtgtgggatagcgaatcgatgccttgtgactggatctcggcatcatgtaccccatata
caagaagggagacaggttggactgcaactacaggggtattacgatgttgattaccgcgtataaaatattc
tccctgatccttcagtatcgccttgtcccgcacgtcgaagagatagtaggaaactatcaaagaggattcc
gaaacggaaaatctaccattgatcagatcttcaccatgcgacagatcttggagaagatggctgaatacag
acacgacacataccaactcttcattgacttcaaagtcgcatatgatagcatagcctgggtaaaactatac
gacgctatgagctcatttggaatcccggccaaactgataaggctagttagaatgactatgaccaacgtca
catgccaggtgagggtggatggaaaactctcaggacctttttgccaggcttgcctgtctcctattcaacc
tggcgctagagagggccatccgcgactcgag
>BAMHI_AL   A.lumbricoides BamHI repetitive DNA.
ggatccgagtaagtgtgcaaaaacagcattatttatgtaaacgaagctcaattacatttctaagtgcaat
tacggctgtatcacgggttggcaactccatattccacggaaatccacccattcaacgggtgcaattcccg
tgagtatcgtaaaataggagagtgaaagctcagaatgcggctagaatgtgtcatcttgttgccaaatcgg
agatatgtatcgtgtgaattgacatgtatcatgccaaggtaggtcggaaaggccaaagaaaagcggaaac
cagacggtcggaaagtacagaactcgattcttgcgattgtgcatcttcgagttctggtaagtgtaaatgc
gagtccggtgtctgatcggatctgatcggccagtgccgaggcttacacgtgactatcacatagtctcact
ctttcactcttcccttttcgcgatttccgattcagtgctaacaactcgacgtagacaccccactctttct
cctgcgcattcctatgccggtcaccgattgggtcgcaaaatgccaaaggacagggcatgtaagcccgcat
cttaattgttaagattcaccgatgaatcgtcaaaaattttgcaaaagctagtggaaaacggggttttgag
gcccgttccaccggcaaaccgtcatcgtgcgccgatcagatggatcc
>APAIA_ME   M.edulis ApaI repetitive DNA sequence.
gggcccgtctggccaccacagaggttcaaagttgcccatttacgtattttccatatcaaccacacattcg
gtactcttcggcatatccctacggcaaagttccgaaccggacctagctcattttaaaggtattgacccaa
gctattccccacttaaatatttttctgggatccgggccc
>APAIB_ME   M.edulis ApaI repetitive DNA sequence.
gggcccttttttggcccctaattcctaaactgttgggaccaaaactcccaaaatcaatcccaaccttcct
tttgtggtcataaaccttgtgtttaaatttcatagatttctatttacttatactaaagttatggtgcgaa
aaccaagaataatgcttatttgggccc
>ARS_EH   region.
aataataaagataataaagataataaagataataataaagataataataaagataataataaagataata
ataaagataataataaagataataataaagataataataaagataataataaagat
>ASSAT1   Ascaris suum satellite DNA variant.
tgatcaattattcccttccagatgataatgaaataattctcaaattgcatgaataatgcattataaatgt
cctttatcgtgacacaagaaccgatgatctggatccaactcgacggcaaataa
>ALSAT2   A.lumbricoides eliminated chromatin satellite.
ggccttttttgtgcattatttctgcaattgggatttattcgatgatcaattataaaggaataattaatca
ttctgctgtcaaatttgatgcagttcagccgaacttgtaccacgataaaacgcattttttgtgcattatt
gctgcaattcggatttattcgatgatcaattataaaggaataattaatcattttgctgtcaaattcgatg
cagttcagccgaacttctaccacgataaagggcattttttgtgcattaccgctgcaattgggatttattc
gatgatcaattgcatgggaataattgatcattttgatgtcaaatttgatgcagttgagccgaacttgtac
cacgatcaagggcatttcttgtgcattattgctgcaattgggatttattcgatgatcaattataaaggaa
taattaatcattttgctgtcaaattcgatgcagttcaaccgaacttgtaccacgataaagggcatttttt
gtgcattgttgctgcaattgggatttattcgatgatcgattgcatgggaataattaatcattttgatgtc
aaatttgatgcatttcagccgaacttgtattacgataaaggcc
>LINE_BG   B. glabrata 'Line-like' repeat.
gatccaacaataccgacaaaagaggtcgtatgactggaggatatcttccttcaacatgatttctgcatac
ttaatgatgcatcaccgacctacttgcacccaggaactggatcactcacatgcattgacctcaccgtatt
gcgtccccgaacttctggacgattttaaatggtcagttagcaatgatctacggggaagtgatcacttccc
aatcatcattactaacaatctcccttcattgggacgacctcagcggtggaaactaaataaggccgattgg
gaacaattccaaaaaagatgctccgaggatatcacagaaaatatcctccatgaacagaacccagctgata
cctttgctagcaagctactaagtatagccaggaaagttgtacccctaacctctgcaaatccaaaacggcc
tagcaaactatggtttgattcagcttgcaaaagtgctattggcgataggaaaaaacgactggctgcattt
ataaagaatccttcccaggaaaacctaaagctattcaggatagctagagcaaaggctagacaaaccatac
ggtcagccaaaaggaattcctggagaagttttgtcggcagtctggatgtccaaaacttctgtcagagcgg
tttggaaggcagtaaggcgaatcaaagggaaagaatcaaatgcatagggcatttgaaaaaccaaggagcc
aacctgtcacttcccccagagaaaatagctgactgccttgcatccacagcacactacacgccagagttcc
aaaaattcaaaaccagggaggaaagacaccccattgatttcaggtcagagaacaatgaagactacaacaa
accgttctcgcttgaggaactgagggaatcgctggacaagtcacatgacacagcgcctggagaagacgaa
atccattaccagttcctcaagcaccttcccgaaccctcattggcagtcctgctaggggtctataattgtg
tgtggcaaacaggcgctttcccaaacagctggaggaaagccacagttataccgatacctaaaccgggaag
agacggctctgacccagctaactatcgaccaatagcactaacaagctgcatctgcaaaaccatggaaaga
atgattaacagtaggctggtctggtacctggaaaggaataaagtgatctcaaactaccagtgcggattcc
ggcaggggcggacaacaactgaccacctggtaaggctggaagcttatattagaaatgcattactcagaag
agaacatctagtagctgtattcttcgatatagaaaaggcctatgacacaacctggaaacatggcattcta
cgtgacctggcgcgtatggggcttaagggacacctcccccgttttgtggaggaattcctgaaagatcgaa
aatttcaggttcgagtgggcaactccacttctgacactcatgaccaggaaatgggtgtatcccagggcag
cattctgtcagtcaccatgttcaacattaaaataaatagcatcataaatgcgctgtcccctggcatagag
tgctctttgtatgttgatgactttgtcattcttacttatgggaaaaacatgaacaccttagaaagaaaat
tacagttatgtttaaacaaaattcagggttgggcaaagtataatggtttcaaattctcagactccaaaac
agttagtatgcatttttgtaatctaaggggactccacctaaaccctgaactatttatacacaaaaagaag
atccctgtcgtaaaaactacaaaatttttaggcctcaccttagattccaaatttaattttctcccttaca
ttaaggaacttaagaagaaaggccaaaagtcattaaacatactaagagtactcagccatacggattgggg
agctgacagagataccttgctgctgctctatcggagtctaattcgatccaagctagactacggatc
>BLTR_SS   S.soubrense B LTR (long).
gagctttttgagctttcatcgtgtggtgaggctgagtcagcaattttttaatgaaagttagatggcgcgg
tagataaagttttcaatagggtaaacgtgagcaagatgaatcatattatcaaaatatttagtaaacatac
aaacaaacatattcaaactcaaatacctgatgaaattattttaaaaattttcaagtactttttctatcaa
tgatccaatttaccccaattttaccatagacaattgcgcttttcgagctttttcataaaaactttt
>BM1   Bombyx mori Bm1 repetitive DNA element.
gaactcgtcgtggcctaaaggataagacgtccggtgcattcgtatatagcgatgcaccggtgttcgaatc
ccgcaggcggtaccaatttttctaatgaaatacgtactcaacaaatgttcacgattgacttccacggtga
aggaataacatcgtgtaataaaaatcaaacccgcaaaaattataatttgcgtaattactggtggtaggac
ctcttgtgagtccgcacgggtaggtaccaccgccccgcctatttctgccgtgaagcagtaatgcgtttcg
gtttgaagggtggggcagccgttgtaactatactgagaccttagaacttatatctcaatgtctgtggcgc
atttacgttgtagatgtctatgggttccagtaactacttaacaccaggtgggctgtgagctcgtccacac
atctaggcaataaaaattaaaaaaa
>BM2A   Bm2a repetitive element.
cacacatcattacggatcctcccgacccattaacggtgcttttaagtaccacaagcaccagtcaccgtcc
tcgttgaacccgtcgcttgcgacgaagggcttgacgagcgaatgaacccacagacacagcccactgagtt
tctcgccggatcttctcagtggntcgcgtttccganccggtagtatattctgcgaagcgctgcttttgct
agggctagtgtaagcaacactccggtttgagccccgtgagctcacctacatgttagggcgantgnanaat
cagcctctcaagaccatcagcataggtaggaaaaaaaa
>LINE1_BM   LINE1 repeat family; retrotransposon.
[encoded data, 5183 characters]
gcctccgggccaccagtaatccttcaatcataaaaaaaaaaaaaaaaa
>BMRP1   B. mori silk fibroin repetitive sequence.
ggtgccggtgccggttcaggtgctggtgctggttcaggagctggtgctggttcaggtgctggtgctggtt
caggtgctggtgctggttcaggtgctggtgctggttcaggagctggtgctggttcaggtgctggtgctgg
ttca
>BMRP2   Bombyx mori non-LTR retrotransposable element.
[encoded data, 4185 characters]
>BXSAT1   Bursaphelenchus xylophilus satellite repeat.
ccggtgtctagtataatatcagagtttttcgcccagtgtcggcgtaatttgattccaaaaaagctgaaac
ttgccatgctaaaatctcaggcgattagctttcgaatggtgtatgtcttgtcaattcactccgtcatcac
taattcacttttttttaaaa
>C6_TC   C6 interspersed DNA element.
gaattccaaccgctgatgcgcatttgttacgaaaggcaggaattatcgaggacgcttcgtccagatacgg
gcggatggattaatacctttctcagttgtggaggagaaaaccaccggtttacgacgacgacgatggatcg
cgtggccacgcgacaagaacagagacgcccttacgaggcgaatgttcctcttttacatattccattatta
ccgcctgtgatggcgaggcgcttctcttgattaagcatcccttttttaagtctctttacgcggagactcg
gatctctttcgatgccacgtggagtacggctgcgctggtggagtcgacacggctcccaatggatacaagg
ccagccagaaattctccagttattacttccgacaattgcgggggtgacaacggtggttcgcccctctggg
ccgcatcaccaatggtcgatcgacgtatgatcatatatacgcataacacgggtcaaaaagcgatgtgata
tcgtgggaggcccaagtgctttgcaatgcggacagttgtcacgcatccatgggggaagaacgcgaatcgg
gcgctacacagtacaccttcttggggtgcagtttgatcacacacaccgggcggtatccctgagtgacaag
tttgtccgctctgtacgcgccatgccggcgttaattctttgaccatcgcggaaatggagattatgcgtca
cgctttttgtacgcggctgccattttgggcacgcgtttatgtgactactacttttttattaaggcagtgc
gacgacgattgtccgcacttaaccggggattgtgcaggagacatccccggcgaacctacgcctacagcgg
ttggtttgggcgagagattgcgacacaccatcgacgataatcgtaagcgaaacagtcaagcccacggaga
aggcatcggctgccatcatcacacggcacgcatcgctccatgatgggagccgtttttattccagacttcc
ggcgacgttaaaattgccggagaaaaatgggagaggaagccttttcttatcatgcaggccgaggcacgtg
cggtacgcttagccttatcggccttttccgccattttgccatccaccatgggcgtttgggtggacaatac
ttcgctgcaaggagcggcgaataaaggcagctcaaaatcacacgcgttgacgtgggagctgcaacggata
tacgagtttttggactctcgcggaatacaggcaacatttgcctacgtgcggtctgcagaaaaccccgcag
acgatatcacgcggtcgtgtttttacacttcagacttggcgaaggggtggaacttccgaaggggagcggc
ggggtcttgtggttgtaggaccccaaagtctgccacttcgtaagtaataatattttcaaatcctaactga
ggacaaggaccatgctaatggtccacggaattc
>CCRP1   Grasshopper repetitive sequence.
tcctttctcctaatcggctcggtaatctgccttcttaatttgttacgtagcatttcaacgagggtgctat
acctatacaaagtttcataaggcgcactctgacaggactgtagttacacgcccttgaatatagcagggaa
ggtccgtgccacgtgacgctggaaattttatcggttttcggagagga
>CLAI_CT   C.thummi ClaI repeat.
tatatttttttgaaaagagcctactatgatcgaaaacaaaaaatgctttaaatagcattttaaaacatat
ctggtattataaatgataaagaatgcaaatttcgtataaata
>BR1_CP   repeat constant region.
accaagcaaatcaggacctagaccaagccaatcaggacctagaccaagcaaatcaggacctaaaccaagc
acatcaggaccaagaccaagcaaatcaggaccaagaccaagcaaatcaggaccaagaccaagcaaatcag
gacctagaccagagaaatgtggtagtgcaatgagaaaggctgaagctgaaaaatgtgccagaagaaaggg
tagattcaatgcaaataaatgcagatgtacctcagctggtaaaccaagcaaatcaggacctagaccaagc
aaatca
>BR6_CP   repetitive region.
aaagagcctaaatgcgatgatgaaatgagagaaagggtcaagagacgttgtgacaatgagaatcgccgat
ttgacgcaagaagatgtgaatgcggtgagaagaaacgtccagaagataacgatgacgaagatcgcccaga
acgtccagaaagacccgaaagacctgaaagacctgaagaaccagaacgcgagcccgaaaga
>CRE1   C.fasciculata retrotransposable element (CRE1).
aacggcattcggtctagtgggtccactcccaaccttctcctccttggtctcgggttcgattccggtcggg
cacgaaactctcttcctctctaaactccacatatacatccacaataaccactctcataactgttctggtg
cggggccatttcgaaccatattgacatttggcgcaccaaactcacacatactaaccaaaaatggcagagc
cacccggggcgacggtccgagcgtggcggagcacctcaagcgccggcgggtcgaaggatctgagccggtc
gtggtggggtctcgccaggagggtctctccggtgagtcagcagtcgaagcgattgttgtggaaagtggca
gcgaggctgacgaagaatccacggcgagggggctgggagcctctcgacaagcgccaggtgatgactcggg
cgggccggtgcccagggcggaggaggacctcgccccggttgggtacctgtatcccgagaacctggccgtc
ccacagggggcggcgtgtccggtggtgggttgtgggtaccgaccgaacacccgggtgggaccgagactgg
tggaacacctgaacacggtgcaccgggatatcctgggcaacattcctgtcgacgcctggcgacgtcaggg
actcgtccgctgcctacggtgtggctcggccttgaccgcgtccggtcatggtcggggtgcacacggtggg
aagtgtggtccgtacagaagcagaaacgcggccattagggctcggacgcagagtttctttggtggaattt
cgcagaattctgacacacttacggcgggaaacggggtctcagaagctggtggtctagtggaagtgggtag
ggtagaagacccaaccacagacccgtggtacagggttcgaacccccttgaagcgacaaatttaccgtacg
gacttccgggtgtggcagggcttggcccggccagtactcctggggtactctctggcggatacagcaggga
aggagggacgccttctcgccctgctcaatctccccagggaccatctggaggtccaggtaaatgctaagag
gggaatccaaccacagccggctgaaatcgaggcccaggttcgaaggaaggtagtggagttggcagggata
ggagcggtaggacgagcgatggcagtgatgactcgggggcggctggtcgaggtgcccctggagcgggtga
tggagcagctcgaggagctccacccgcaggaggacccgcggggttatccggcagcaccagatacgagcga
ggtgctgcgggccaaggagcagaaggtgcggcgggcgatcgcggcacggatggggaggggtacggcgccc
ggcctcgatggctggacgcgggagctcctcctccccctcgcagaagacccggccctgctacacgagatca
cgtcggtggtctcggatatcatgcaggggaaggtggccgaggtggtggcgcggaggctgcggagcagcgc
cgtcaccccgattccgaaggacgaggcggggacgaagatacgcccgatcgtgccggagtcggcctggctg
aagctggcctcgctggtggcgatggcggagataccatccagcttcaaggagaccttcaaggggtggcagt
acggggtctggggggacgtcgccaaagcagtggcgaagatccgccgggacagcgaggagcacgagtacct
ggtggcactcgacggggtcaatgcatacaatacgatgagcagggcccacatcctccaagccgtgtacgcc
gagcagcgcctgaagccgatctggggggtggtgaaggtggcgcttggggggccggggttcctgggagtat
acagggacggctgcctcaagggcaacctgtggtccaccaagggaatccggcagggcatggtgctgggccc
cctcctgtacgcgaccgggatggcagcggccatcgggccggtacggcagcgtatccccggggtccccgtg
acggcctacatcgacgacatcaccctcgcggccagcggggcggagggagccagggcagccgaggcatacg
cagacgccctcgagacggtcggggtggtcaccaacgccaggaagtcgatggtggtggggccagaaggcac
ccgggtggggatcgggggtgtagacctgccggtggtggccgaggcccggatcctgggggcccacttccga
gcaagggggacaccagaggcccgtaccatcgagtggctgcaggcggccgtcgagaagtggcgacccatcc
accagaagctgcggcaggacatcatcccgaagaacattgcgatgatgatgacccgcatcagcctggggtc
caagatgaccttcctcctccagacccactcgccacaggaactggagaccgcagcgaagacggcagacgac
gaggtcgagcagaccctccagcaccttatggggcaggtagagatcacgccccgagcaaggctgctggcac
aactcccgatcagagagggggggctgggtctccggcgaagcagcgagattgcgaagttcgcacaggcaga
cgtggggcaaggcgaggcccaccaggcacacacaaaggcactagatgaagggatcaagcaccagttacaa
ccactcctctcggagtccgaggtgcagatcctgaagtcgaacgctggaatgggggccgggcgggtgctga
cagatagtagcctgaggatcccagacgtggcagcaacaatcgcgctgagggagagactcctgctcagggt
gctcccggagggatgcagtgtgtgtgtgggggggacgcgacgaactaccatgtacacacgtgctccaaca
tacccaccaagccccggacccgacgacacgacggggtggtggatgagctggtggccctggccaggaagat
ggggtacgagcccagcaaggagccgagggcggacgttgacgagtagggcgaggccggacctgtacatcac
aggaagcctgaagccggcggcgacggatgtaacaataacctacccgggcaggcaggcgaggggagcacac
tcccgttgcagcaggcctaccggaataagatgggggcctgggaggcatgggggaacctgcgaggggtgga
catgcagccggtggtcctcgggacgaacgcggagatacacccggagagtgcgaatggatacgaaggttga
cctcggtcgaagacaaagacaaaatacataccagttacaacgaggtgacgggacgaatcgtggagacggt
gttggttgggaacgtggagctgttcaacgcagtgacgaacctggcgctggtcagggagttgatgtaggaa
ggtacgggtgggtagtagtagaatatcgaacggcgactaggaagttggaccattgttacttgttacttgt
gattctgacgacgacgaaagattgttccttgttacttgttaccctgaaatttgatattacttgaattgat
atgatatgattgatacaaaaaaatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
>CRE2   C.fasciculata retrotransposable element (CRE2).
[encoded data, 9727 characters]
cccgc
>CSP2034   S.purpuratus repetitive sequence csp2034.
aattccatttcccgtttacgtgtaatcgccatgggaaatgtgttggtatatcggtaacgcacttgacttc
caagctcgagatacctggtttgagtccgggtgtctccaacaatttttgtcttcatttcttttttcttttt
gacctttcactgtaccatctcctttgattattaaaacattattcgcaaataatgtaataaacaaccgtat
ttaccttattattacccttttttccacttaatccattatttagtgcgtgtagtccctatgggggatgact
tttttttcaaatctagattctacattcctgtcttttgcgagcaatatcgccgttatttctgcttggattt
agttgatttttgagtatgttgtagctgagactatatgctatctaaatcattcctcattttttcaattaga
tatcaggatcacgcttatgatcatgatcattatcatctcatttctcactgagtattatttatatgtctgt
ctctcccg
>CSP2090   S.purpuratus repetitive sequence csp2090.
aattcgggatcaaaaccgtgtcgatgtgctatattagtgcccttttaggggttcctgactgacctaaagg
tttataattatcattgaagcatgagctaaatccaggattttgtttcagaatctgaggcctgtcttcatca
gctcgagattgccaaataacccgcccg
>CSP2096   S.purpuratus repetitive sequence csp2096.
aattcgggtacgagttggattgtaggagtgtagtgagtctttaatgtattgtggcgagattccatggaga
gcccgataaacaagtaacataattttgaagtggacccttttctggacaggtagccagtgaagagagcgta
atataggcgtaatagaagacattcttggccccccccttctctctctctctctctctctctccg
>CSP2108   S.purpuratus repetitive sequence.
ctgacttggtcgacagatctggaatgagcttcccttggtaattgatcatacccaagaaccgttggacatc
tttccgacatttcggtctctcaatgttcaagatagcagacactttctttggatcacgttgaactccttga
tcactgatcaagtcaccaataaatgtgagcttcttgacattgaactcgcatttgtctttgttcaacttga
gatacatttttttcacaatgctgagaacctctctcaacctgttatcatgctcctgttaggtagttcccta
tacaatcacatcatccatcattgtgttaactc
>CSP2111   S.purpuratus repetitive sequence csp2111.
aattcggattaacctcggctccttgactgatcagatatttggtgacatcaagatgaccacagccccactg
cactacttatagcctattgcgccctctatatagcaaacaatgcctaataggtgaccattggtcacacatg
gtcccctttttcccg
>CSP2112   S.purpuratus repetitive sequence csp2112.
aattctaaatcctgaaatgtcatgcgctctcttatctcaccactggtcaatagttgaagattagcgcata
acttttcggcggcttggagcatggggtcaaaggagagcggcttgattccagtccttctctatcacgtccc
ataaggaccggtattcataatacgagaagagggttggtattcataatacgagaagagggtcgctgttcat
aatgcaatatcggggtcgtgtcaaattttcaaatttcgagaccaccg
>CSP2137   S.purpuratus repetitive sequence csp2137.
aattcgtttgataaaattatggagagctcgcatgatacgtcatagagttgccaatttgtgtttgattgat
cacaacttcaaaaatcctaacttcattatttttaatcggaatttgctcaaactttcactgacttgtttct
ctcatttttctactcctatttaaactaacttaatttcagggtggactttccctttaaagcctcgttacga
attatttcattcaccg
>BR1_CT   Chironomus balbiani repetitive sequence.
ccaagatcaagaccaagcaagggatctaagcctagcaagggatccaaaccagaaggaccatctaaaccaa
aatccagacccgaaaaaccatctaaaccaagcaagggaactaagccacgtccatctaagcctagcaaggg
aactaaaccacgtccatctaagcctagcaagggatcaaaaccaaaaccagaaagatgcggtagtgcaatg
agaagagttgaaagcgagaaatgcgctgcaac
>BR2_CT   C. tentans beta-repeat in Balbiani ring 2.
aaatgcggcagtaaaatgagaagagttttagccgaaaagtgtgctgctagaaagggtagattcagtgcaa
gtaaatgcagatgtttctcaagaccaagttggtcaggaattaaaccagaaaaacgtagcaaatcaggatc
aagaccagagaaacgtagcaaatcaggatctagaccagagaaacgtagcaaatcaggatcaagaccagag
aaacgtagcaaatcaggatctagaccagaa
>D88I   S.drobachiensis repetitive sequence D88I.
tttattatatacctcacttaagaaatccagccatctgatcggtcaaaattgcaggccgagggcaatggca
caattgtaacctccccgagagcgtataaaaccaactatgtctctcaaag
>DPSAT1   D.pulchellus satellite DNA.
gataatttcgagccagctactttcgtttagccagaaaagtgcttttcgcttgaaacggcaaatcctgctt
tctgagcgctgtagagatgcgggcctgcccaaaaccccctagctctcttcatttggtgtaactatgcatg
aatcaaaagagaaacccgatcccgagctttataattgctgggaaaacgcgttttaggcgaaaacgcgagt
acggtcgatttgcgtcgaaaagcaaaaaacctgctttctgagcgctgttaaggccggggatcgctgtaaa
ccctctgaggcgtttcaattagtcaaactgtacggtggaacagt
>DRE   D.discoideum retrotransposon DRE.
[encoded data, 6461 characters]
tctagcatctcaaggagaagcaaataataattgcgttatccaattcaaaaaaaaaaaa
>DRP_EG   E.granulosus EgDRep repetitive DNA element.
caaatttgatggtatttgagctgtcttacttagtatcttcacgaatcctacgtagcgtcccgagactccc
tgaagacgaaagaagacaaaatactcgggcagaatatatattcagcgcagagaaggtgtctgggctattg
catgcccaaaaggccagcccacccagcgaggtacaagggggctaattcaaagtacaaaagtggcgcctca
ccagaaccgagggataaaccgctgtcgtattacacttatgcgttttatgatggggtaatctgaatcagat
ttttgaaacgcgctgaagttctgcgaactataattagggctaatctcttagtaatatatcatcccatgtc
ttcttcagtcctaaagagccaaagtaaggtactaaaaatataatacaatacacaaaagaagctgcaagac
tgctggtccggttggaaggacgttgtcttttgttcacatgttatgtttaacaagcaatcaaagccttaca
tcaaat
>EHINV1   E.histolytica inverted repeat downstream of rRNA genes.
aagctttagagtttcttaatcaatactctcgggtattgaatgaaacgatttgctgagacttaaccgtaat
ttctatttaaatttatataaaattactcattttaaaaaggttattctttctttttttatttatttaatat
aaatttattgatatttattgttttttatcattaaatatttaaattaattgattgtctttcttttttatca
tttaaataaataatatttaatatctcaaaaaatatcaactaaagtataaatattcataaggtaaatgttg
ttcataattaaattctaaacatttattattttaatattctttaatgattgattaattgattgtctttctt
tttttatttgattgtctttcttttttatcatttaaataaataatatttaatatctcaaaaaatatcaact
aaagtataaatattcataaggtaaatgttgttcataattaaattctaaacatttattattttaatattct
ttaatgattgattaattgattg
>EHINV2   E.histolytica inverted repeat downstream of rRNA genes.
aatgtttcttagtactattaacatttgaattgaaaatagtttaaataatattatagttttttaatataat
ggatcttcttaaaaatagaaatttaaaatagataacacttccttcatatgtcttgaataaaaatgtatct
actatttgaatataaactattctataaatagaacattaaataaaatattttataatatctcagttataca
acgttcagaattaat
>EVSAT1   E.vuilleti satellite DNA.
accgattgaaatttcataaaatgcccgaaaatccctgtagacgatgtccaggtgtcaggatgacccccag
gtcgacgtaacaccatctacgaggaatgcaccaggt
>FALCI   P.falciparum repeated element falci.
aattaagactatgttagtgaagttaagacttagttagtcaagttaagactataattgttgaagtatgact
ttattacttaatttaagatctaagttagtaaatgtaagacctaagttagttaaggaaagatctacgttag
tcaa
>FR1   FR1 repeated sequence.
gaattcgtgtaaaacgtactttctttgtttttctatgagagaagacattggttgacctttttacaccggt
cacaacgaatattcgtgattgcacttccactacaatctgtttcacggatgagttgaaggaaatatcggat
aagcattctttgtcggaaatcataatataaaacgtgctcttctatgtcg
>RP1_GL   non-coding region of a surface antigen gene.
gatccattgaattgtgttgctgtctgagttccaatagtttttgtttccgctcttctgtagaaaggttaag
atgaaaggatgtcataagggcatctctctgctgcaatatgatcaaggagtcaaaggggctgccctccaca
gctgactcccgaagctcgattgatctcacgggcaattcttattcaatttctggccgtccggagatgaggg
ttggttttggataacataacgagagagtcctctccagtgatatatccagagcctagcgccttccccggtc
gctccgcagggggtgtgctcagaccgaatgcgtacttcggtcctttcggggttcaggccttcttacggac
tctctggtccaccaatggcgcctcttcttggtcttccttcgtggcgggtgaagctccggtcgctgtcttt
tttagatgccccgtctgtcgggggctgccatcgggctctccgctggctgggccctcggtgtccgggcagc
tgtggctcgagtcagcgctcccacagtccagtcacctgtgtctcagtgggccggctggtgggtggggcgg
gggtatggggcggtgaggctggaggggctctggtgggaccaggtggtgggtgttcgtatgtgcccctgag
ctcctgatgagtggggtgatcgcagctgtggtgactgggggctgtccatctgtgactcacccctctgtgt
gctcgtggtctgtgagtgcctccacccagacaacgcctcaggagccgtgcacaccgggacagagaggatg
accaagggggtcaagcagccccgctacgagagatgagagtgcacagcaaccagcctgatc
>GLSAT2   G.lateralis satellite DNA.
aacaagaagaacaagacgaagaaagaagaggaataacatcaacaacaccaagaagagcacggacgactac
aacaaggagagggggaaggcaggaaggaattgccgcgtggcacattccgcatttcaccaagctcccctct
cc
>GLSAT3   G.lateralis 'gc' rich satellite DNA.
agcgcagtgtggcggctgacgatgcaccgcgatacgccgataccggacagtttccttgcttatgtacgga
tgcaataatgttattgcttaattcttcttgttgttcttctcgcctttcttctccttgttcttcttctttc
ttctccttgttacagttgcttgccgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgctggaattggttgttcct
ctcccccttctgtccttccttaacgacgcaccgtgtaaggcgtaaagtcgttcgaagggagaggatggaa
cagatcccgtacgcacgggaggagcgctcacg
>GPRP1   G.pallida repetitive DNA element.
agctttaccacatcatttcatagtggttccaattgtttcccgggctagggaataaaaataaatttattat
aattttttaaattatcccaatgcgcccaaacatagggggtacccttttgctggtgatatttggtgtacaa
aataattcataaaaaatttatttatcaagccctagggaagcaattgtcgcactgtatatttcatctcctg
atccttattggacaaaaattagcctcccatacatgcgttgaatgggtgatatagggtggggtcgtactac
aaaaatggacaaaaatggacaaaaatatttttaaatttccgggagtctcctgagcatcacagcacatgta
tgggaggctaatttttgttcaata
>GQRP1   G.quinquedens highly repetitive DNA fragment.
agcttatcaccacctgtaacaactttttttgtataagtccccaagcgcttcaccgtgccacagccctgct
tttggccgtcaagct
>MARINER_HC   H.cecropia mariner-like repetitive element.
ttaatattaggtccttacatatgaaattagcgttttgtcgtactgaccactttgatctgaaatatctcct
ctttggttaagaattccaattccaattcatttagctggtacatttgagatttgaaaacagtcattcattt
gttttttcctcattattttttccttaggcatcgtttattaccgcacaatggcaaacatgaaatatcggta
tatttacgagtacgagttctaccgtggcaccagtgctgcagaaacagctcgaaggattaataatgtatac
ggtgctggtgccgcaaaagaaagcaaggtacgtttttggtttcaacgttttcgttctggaattttcgacc
ttcagaaccaaccccgtggacggccggagatcaaagtggaaaatgaagaataaaggctattgtgtaagcg
gatccatcacaaagcacttcagagatagctgcaggcttcggggtaagtgataaaactgtattaatctact
tgaagcaaatcggaaaagtaaaaaaacttgaatgatgggtacctcatgaattgagtgaatcgaacttgca
aacacgcgtcgactgctatgttactttgctcaaccgacacaataatgaacgaaaaatgtacgataatcgg
aagggctcgttgcaatggctgaaccctggagacccagccaaatcctgccctaaacgataattgactcaga
aaaagttacttgtgagtgttttggtggactagcgccggtgtcattcactacagctttctaaaatgtggcc
aaacgattacagtagatatctattatcagcaactgcaagccatgaaggaagaactagctgctaaacatcc
gagattggtcaatcgctctaggtcactgctgcttcacgacaacgcaagaccacacactgctaaacaaaca
accactaagttaaataagctacaattggaatgtctgcgacatccaccgtactccccggaccttgctccaa
tagattaccattttttccgaaatttggacaacttcttacatggaaaaaaattcaactcctattcggtagt
ccaaaccgccttcaaagagtttattgatcgtcgcccccatgctttttttaataaagggatcaatgaacta
cctgtaagatggcaaaagtgcataaataacaacggtgcatactttgataaattaaatatattttacaaaa
aaataattgacttcttattcctcccttacaaaacgccaatttcatatgtaaggacccaatattaa
>HHAI_BMA   Brugia malayi Hha I-repeat family element.
gcgcataaattcatcagcaaaattaataaaactttcaattaatcatgattttaattgaatgtaagaattt
aaattaaatttaaattcaaatttaaatttttaattttttaaaaattttaaaatttgttatagttttcctt
cattagacaaggatattggttctaatttatcaattttaattctaattaagtgccaaaactactaaaaaaa
gcttattttgaaattaattgactacgttagctgcattgtaccagtgctggtcgtgtattgtgttgtcatt
ttatagtttaaatattaaaatacgcttttgtaattaagtttt
>HTE1   Holothuria tubulosa repetitive element, clone HTE-1.
aattcaaaaaatcagctattcggcaccataggtcaacgcgctgcttatttttctactttcggttaaaata
tcaagtcatttcaataattcattcaacagaaacagttggtacattgtgtcaatgtaattccacccagtta
atagtcacgaaccgaaaatttagtaactttttaaagttccaccatttcaagtacctttgttttctttata
tgttcataaaaatccaaatccaattccataggtcaacttgtcgtcaccatttttacccatgtagaagata
taatgtcgaaatctgtatttgatcaagatatataaagggtacatcaaagttctttacaggattcttaaaa
ctgaaaaaagtcctaacatttcctcgtattcttgcttcatg
>INGI   T.brucei repetitive element ingi3.
[encoded data, 5254 characters]
cacgaagaaaatttcaaaaaaaaa
>LARP1   Leishmania aethiopica DNA repeat.
gcaagaagcaagaggcagtgtcacagagatgggcgaagggggacggtgggagcgggagagagaccgcggg
cacgtggcgacgcccgtgaaatgaaaaaaagcagaagacgcgtattcccttttgctgatgtgtgcctacc
tctctgccacagatcacgacctcagctcccctccaccccaacgcctcccccgcgcggccctgtcacaggc
tccc
>LARP2   Leishmania archibaldi DNA repeat.
gcaagaatcaagaggcggtgtcacagagacgggcgaagggggacggcgggagcgggagagagagcgcggg
cacacggcgacgtccgtggaaagaaaaaaggcagaagacaacgcgtattcccttctgctaatgtgtaccc
gcctctctgccacagatcacgaggccagctccactccaccctaacgcctcccccgcgcagccctgtcaca
cgctccc
>LARRP1   Leishmania arabica DNA repeat.
gcaagaatcaagaggccgtgtcagagatggacgaagggggacggtgggagcgggaaagagacgacgggta
cgtggcgacgcccgtggaaagaaagataagccaaagacgcgtattcccttgtgctgatgtgtgcccccct
ctctgccacagaccacgagctcagctccactccaccctaacgccccctcgccgtcccctgtcacaggctc
cc
>LCSAT1   L.cuprina satellite DNA.
gatcggtagaattatttttccaggtttaaaaaggcggtaatctgaggttccgatatggttgtgaataact
ttgacagttttcatgctatgacagtcatttatgcatcattttaaagcattatgattgcactttaatttgg
tatatcatttgtagcataatgtgtgtttttacaaattggtcaatttgata
>LDRP1   L.donovani highly repetitive DNA.
taaccctaaccctttttctctccacttatccttgcacagcgacaccctctccaacaggacggggcgtgac
ggtgtactggtgtatggttagggtta
>LDRP2   L.donovani highly repetitive DNA.
cccctaacataacataataaccctaacccccccctctttgaaggaacgaagaatcagtggagagaaaaac
cctaac
>LGRP1   Leishmania gerbilli DNA repeat.
gcaagaatcaagaggccgtgtcagagatgggtcgaagggggacggtgggagcgggaaagagacgacgggc
acgtggcgacgctggaaagaaagaaaagcagaagacgcgtattcccttttgctgatgtgtgcccgcctct
ctgccacagaccacgagctcagctccactccaccctaacgccccctcgccgtgcggccctgtcgcaggct
ccc
>LIRP1   Leishmania infantum DNA repeat.
gcaagaatcaagaggcggtgtcacagagatgggcgaagggggacggcgggagcggcaaagagagcgcggg
cacacagcgacgtccgtggagagaaaaaaagagagagacacacgcgtattcccttctgctaatgtgtacc
cgcctctctgccacagatcacgaggtcagctccactccaccctaacgcctcccccgcgcagccctgtcac
acgctccc
>LLRP1   L.loa interspersed repetitive sequence.
accgaataaataactggagtgacttcttgtctaggaatattttccaatctaatttcacttccacatgctt
cttatttactttatttgcacgcataatgagtctgtgaagaaaacccttcgctatcctcatgaaaaagcat
ttacatgtagatcaaattctcgaaattggaacggagacaacgagtttcacttcgattgaaacaagcagca
tataaaagtgtcattgtcgtctattgcgaattgtcatctagcctggggtttattaatggtttgctaaatg
gttataaatatcgttggatgactacagcagtgatcaatttgatgaggttgttgtgtaaatacgttgtccc
tcgttatcccttctgactgtcgaacaaacataaatatgctattctgccattctgattataccgttaaagg
agaaaatcagagaatcatttacataaacctattattactattattattaaaccaaatattttgatattcc
aaaaagactaacaataacgatgaaagttgaatttataacttcggtatgttaagtcaaaagtaaacaacct
ttagaagcaatttaatgttagatatcgagttataattatattggaatagattgttcaaatattgataaga
tcaaacaaagattatcactgcaaattaatcaaatatacagttgatttttcattttcggaactttttaatg
aataatgccagaaagcaagagttcactggaattgatttcaagattactcagttaacttactaataatcaa
atgatctataattagaatgatgaacagggtcttatgatagcgtaagt
>LMRP1   Leishmania major DNA repeat.
gcaagaatcaagaggccgtgccagagatgggcgaagggggacggtgggagcgtgaaagagacgacgggca
cgtggcgacgcccgcggaaagaaagaaagcagaagacgcgtattccattgtgctgatgtgtgccagcctc
tctgccacagatcacgagctcagctccactccaccctaacgccccctcgccgcacggccctgtcacaggc
tccc
>LTRP1   Leishmania tropica DNA repeat.
gcaagaatcaagaggcagtgtcacagagatgcgcgaaggggggcggtgggagcgggagagagaccgcggg
cacgtggcgacgtccgtggaaccaaaaaaaagcagaagacgagtattcccttttgctgatgtgtgaccac
ctctctgccacagatcacgagctcagctcccctccaccctaacgcctcccccgcgcggccctgtcacagg
ctccc
>U1_LV   L.variegatus repeat unit with gene for small nuclear U1 RNA.
aagctttcgggtctactaccaactagagcccatggaacgagatattaaagagagcaaagtataattttgc
ccaagtaagacgacgaccgataaaagaaaggttgacccgataacaggatgcgagtaagctgacgcttatg
tcattataatctgcaacgtcagtaaagttattgtgaagttcatgaatattcacatccttacttcttcaca
tcttacgtgcaattttgtacttgttattacgtttaaattatagaattacatggatacgtcattaatgttg
ctccagagaggggcacagagatttgaggtttctttctctcaaaacttgccaaaattgtacaaattcataa
aatcatgtgactgttttctctttgtagtgtgagatgtttcactgctttctatcgcagataagatttgatc
aagtacggcgaccgatggatggggagcatacttacctggcgcaggggtcgcattgatcaagaaggatgca
cccccagggcgaggcttgccattgcactccggcttgctgaaccttgcgattcccccaaacgtggggaact
cgggcgtacaatttatggtagcggagatctgcgttcgcgctatctcctacaattcaactaatgcaaagaa
agaaaataaaagctccccgaaaaactctgatggtgacatgaatggactaatcccttccaatttttgggga
atttcaaccttatcaggtttttcaaaccactagtttctttattacttaaggggacatgattggcattcct
ttcaataaaagctcgggtttaaatccgtgtgacaaaaatagcatactactttaacatctgcttcatctca
actgcgaaatgtatgtcgaaataaactttgctaagttttgaaagattctaatgagatttaaaaaaaatga
ttttccggcagattggctcgctcattttactcggtcgcaagtttccgataaaaaccccctccaaatagtt
ttctcattgaaacaacgtcatccaaaatacgtttcaagttaatccttccaatcaatacatattgtaactg
ggtatattttaaaacctattggcccatcgttgtttcttttccatatgaacattagttagtggttaaaagt
tgcatcatgattcgtaactaaaaaaaaataaatgacccgtttaaagcgtcagcttggaccaaccaacatt
ttcgtcaccaatctataaaaaggtaaaatatccaggtgcatggtcatttcccaggggtggagtccaggtt
attgactactcatttaatgtgtatgaactagtttcgattttgtggtgcattttctctttatcccttgata
tggaaataaacaatcattttaactttatcgagatattaagcctcacatttcattctaaaatgagacga
>MAG   Bombyx mori retrotransposon MAG DNA.
[encoded data, 4615 characters]
tctattatttacta
>MARP1   T.brucei Marp1 repeat protein.
gaagaagttgcaaccgatatgcgccacgtggatgagagccacttcctgaccacgacacatgaggcataca
aacccattgaccccagtgagtatcgtcagaagcgtaccgttggggaagaagttacaaccgatatgcgcca
cgtggatgagagccacttcctgaccacgacacatgaggcatacaaacccattgaccccagtgaatatcgt
cagaagcgtaccgttggggaagaagttacaaccgatatgcggcacgtggatgagagccacttcctgacca
cgacacatgaggcatacaaacccattgaccccagtgaatatcgtcagaagcgtaccgttggg
>MBOI   B.malayi MboI repeat consensus sequence DNA.
ccatttctctacagatataacaatatcactagaagacattttgattaattcattaactcata
>MHSAT1   Meloidogyne hapla satellite repeat.
cttggaattagaaataattgtttatatgagttccttgtaaagcaacctctagatgccaccagatataaaa
aattgttgcacagtcaaaactggaaatggtcttcattattgaatatcttacagaatgctgtatctatcct
gaaaaaatcctgtgtcgaacttaattttc
>MISAT1   Meloidogyne incognita satellite repeat.
cttggtttaattacccaagtttaaggtatgtaaatcattactacttgggaaaaattttggaattgtattt
cgaaagaaatactcaaaattaaatcaataattaaaagtttttaaaaaaaacttgatacaaaaatttaaaa
ataaactttttactaaaagtattttatagattatagaaggagaaaagaagcagagaatgtacactatctc
tcattaaatgaagaaaaattaaattttattccccatcaatattttcctaattttatggacattttgtcct
tttatttttccaattc
>BRP1_NV   N.vitripennis repetitive DNA from B chromosome.
ggcagaagaagagggtcaaaagtctagactttggcttactggcttcaatcacgccagttgtaactacaat
ttaatacactagactccaagatatatacaagtagcttatataaaaataatacacgtaagatcctcgcaga
gggaagatgacgctcctaaaactcaaaattattagggtccacgaaaaaaagtcggccatagtaaggcatt
tttt
>BRP2_NV   N.vitripennis repetitive DNA from B chromosome.
ctgggtttaagcacttggtttttagagtttaacctcgctttgctcgccttacgccgatgtgtcgaagagt
tttaataaataatttactgatctcggggggcatggtgtag
>NVBRP3   N.vitripennis repetitive DNA from B chromosome.
tcgagtttgaatcgtcagcatatcggaggaaggcgaacgagggcgagaatttaatttaaaacaataaacc
ttaaacccacctaccctatagaca
>NVBRP4   N.vitripennis repetitive DNA from B chromosome.
gtcggggtaatataatcaaaagtctcgacttatgattggatattaaaagtatatcatacatcgatatgac
aaataatttgcatgtctaacgatattacgtcttaaatgaagaagcagtaaattttataaaacaagatggg
tgacgcttataacacgagcagcagttgagaaagcaatgccgtt
>NVBRP5   N.vitripennis repetitive DNA from B chromosome.
taagttctcggcttacccacctattatcccttctattgcgatggtttatttctactagtagtataagaaa
taattacagcaagtttggttgaaatcgaaggttgggaatctggacaactgggcgctagtagttgtcaaga
aggaatctgaatcacgaatatagatctttgtcgac
>OARP1   Onchocerca armillata repetitive DNA sequence, clone pOA5.
acataaagtatatttttttttagagctgaaatataatttacgaacatgtttcgtattatataattcaaag
gaattttattaaaattgaataattatgctcattcactgctataatatgtgatctgcatgtgctattccaa
aaaaacataaagtataatttttttttagagctgaaatataatttcgaacatgtttcgaataatataattc
aaaggaat
>OK   SINE element.
atatatatataggcgcaggagtggctgtgtggtaagtagcttgcttaccaaccacatggttccgggttca
gtcccactgcgtgcaactttgggcaagtgccttctactatagcctcaggctgaccaaagccttgtgagtg
gatttaatcatcatcatcatcgtcgtttaacgtccgttctccatgctagcatgggttgctagacggaaac
tgaaagaagcctgtcgtgtatatgtatatatatatatatgtgtgtgtgtttgtgtgtctgtgtttgtccc
ccccaaaatcgcttgacaaccgatgctggtgtgttcatgtcccccgtaacttagcggttcagcaaaaggg
accgatagaataagtactaggcttacaaagaataagtcctggtgtcgatttgttcgactaatggcggtgc
tccagtatggccacagtcaaatgactgaaacaagtaaaaatatat
>OR1   SINE element.
cgtggaggcgcaatggcccagtggttagggcagcggactcgcggtcataggatcgtggtttcgattttca
gaccgggcgttgtgagtgtttattgagcgaaaacacctaaaagctccatgaggctccggcagggaatggt
ggtgatccctgctgtattctttcaccacaactttctctcactcttacttcctgtttctattgtacctgta
tttcaaagggctggccttgtcactctcagtgtcacgctgaacatccccaagaactacgttaagggtacac
gtgtctgtggagtgctcagccacttacacgttaatttcacgagcaggctgtcccgttgattggatcaacc
ggaaccctcgtggtcgtaaccgacggagtgcttccattttatatattcctatggttcatcaggaaatatg
tttaccatccttctgagattttgtatatatggatgctattgtttgttctaatttattcaaattgtaagga
aaatttagaatctaaatctacttctgggttatataaagtcagtcgtttgaagttatcattttattctgat
acaaatgttatgtgtttaagagctcctctcttaacgtcagacctcccctttatactgatgctaattcaga
tttcatagttgcttatgattgtactctttggtgtggagcatcacatatggtgtctaaacagtggtagtgt
tgaagcgtggaggcgcaatagtccagtggttagggcagcggactcgcggtcataggatcgcggtttcgat
tcccaaaccgggcgttgttagtgtttattgagcgaaaacacctaaaagctccatgaggctccggcaagag
gatggtggtgatccctgctgtactctttcaccacaactttctctcactcttacttcctgtttctgtggta
cctgtatttcaaagggccggccttgtcactctctgtgtcacgttgaatttccccccgaaatacattaagg
gtacacgtgtctgtggagtgctcagccacttatacgttaatttcacgagcaggttgttccgttgattcgg
atcaaccggaaccctcgtcgccgtaaccgacggactgtttcc
>OR2   SINE element.
ataatcgtgagattgtggtttcgattcctggaccgggcgacgtgttgtgttcttgagcaaaacacttcat
tttcacattgctccagttcactcagctgacaaaaatgattaacgctgcgatgactggcgtcccgtccagc
tggggaacacatacgccattgaaactcggagaccgggcccatgaggctggctaggctttaaaagggcgca
tttatttgtagaggcgcatggcttagtggttagggtgtcagcatcatgatcgtaaaattgtggtttcaat
tcctggaccgggcgacacgttgtgttcttgaacaaaacacttcatttcacgttgatccagttcactcagc
tggcaaaaatgggtaacgctgcgatgactgacgtcccgtccagctggggaacacatacgccattgaaacc
gggaaaccgggcccatgagcctggctaggctttaaaagggcgcatttattatttatttatttta
>OVRP1   O.volvulus DNA repeat.
gatctctaatatcaagaaacgggtacataccctcaaattgagtgctaaaaaaaatgctcgactatatttt
ggtgaatttcaaatttatatcgcgatttttccggcgaacaacgcagtttgcaaaattaattaataactgg
tgacatatgacccctagtttcacgaaaggggtacgtgctttcaaattgagtcctaaaaaaaatattcgac
tatattttggtgaattttcacatttatatcgcgatatatccggcgaacaacgcagtttgcaaaattaatt
aataactggtaccatat
>P126   P.tetraurelia P126 repetitive element.
tttgtttctctcctgatggtactttattagcttctggtagttgtgataattctatccgtttatgggatgt
ttagacaggaaaataaaaagtgaaaatagatggtcaccgcgattatgtaaattcagtatgtttctctcct
aatggtactacattagcatccggtagtgatgattaaactattcgtttatgggatgttaagacaggaaaat
aaaaagccatttttattggtcattcagattttgtgtattcagtcaatttctctcctgacagtactatatt
agcatctggtagtgtagataaatctatccgtttatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaatta
gatggccatttagattatgttaattcagtcaatttctcttgtgatggtactacattagcatctggtagtt
gggataattctatcaggttatgggatgttaagacaggaaaataaaaagccatttttattggtcattcagg
ttgtgtgtattcagtcaatttctctcctgaaagtactatattagcatctggtagtgaagataaatctatc
cgtttatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaattaattggtcactcaggttatgttaattcag
tcaatttctctcctgatggttctacattagcatctagtagttcagataactctatccgtttatgggatgt
taagtcaggataataaaaagccaaattcgatggtcatttatcaagtgttttgtcagtcaatttctctcct
gatcatactacattagcatctggtagtgtagataaatgtatccgtttatgggatgttaagacaggatatt
aaaaagccaaagtagatggtcatttatcaactgttgtgtcagtcaatttctctcctgatggtactacatt
agcatctggtagttcagataattctatccgtttatgggataccaagacgggataataaaaagtcaaattg
gatggtcattcaggttacgttaattcagtcaatttctcacttgatggtactatattagcatctggtagtt
ttgataattctattcgtttatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaattagatggtcattcaga
aactgttacttcagtcaatttctctcctgacagtactatattagcatctggtagtcatgataactctatc
tgtatatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaattggatggtcattcttaaacagtttattcag
tcaatttctctcctgatggtactttattagcttctggtagttgggataagttaatccttttatgggatgt
taagacaggataataaaaagtcaaattagatggtcattcttaaacagtttattcagtcaatttctctcct
aatggtactttattagcttctggtagtggggataatttaaccattttatgggatgttaagactggataat
aaaaagctaaattagatggtcattcatcaacagtttattcagtcaatttctcacctgatggtacgacatt
agcatctggtagtgaagattagtctatctgtttatgggatgttaagacaggataataaaaagccaaatta
attggtcattcaaatggaattctttctgtcaatttctctcgagacaatactacattagcatctggtagtt
tcgataattctattcgtttatgggatgttaagacaagatagttaaaaaccaaattagatgatcatcctgc
cacagttaattcagtcaatttctctcctgatggtactaaattagtatctggtagtaatgataactctgtc
catttatgggatgttaaaac
>PAO   Bombyx mori retrotransposable element Pao.
[encoded data, 4828 characters]
ggaaacagccatacagaccgggtcgtgtaca
>PAT   P.redivivus PAT retroposon.
[encoded data, 5538 characters]
ggtacggtgcgaagttaaaacgatagttttcacgcagtgtaacgcagtgaaaac
>PFH76   Fasciola hepatica clone PFH76 genomic repeat sequence.
gatcaattcacctatttccgctagtcctactggaatttctcttgtaccaatgtgtttctcaggccgtgat
taccctattgacaaagaatcagcgtgcccgtaggacgccgtttaagcccacttt
>PFRP1   P.falciparum 5.8 kb repeat DNA.
taagtatattatacaaataatactagagatttcaaaactcattcctttttctataaatacttgtaaacat
agtcatacatgatgcactagctaatataaatgtaattgttaagattaacattcttgatgaagtaatgata
ataccttcattacttaatggatatggtgataaactaaaatgtaatataccccaaaatatgtaaagaataa
taaagcttcatgaatattatgatagataacataccagaagttaaagatgaaacatacagaataaaaactt
tctcgaatagaatatacaaatattaataggattatagggttaaatgtaaataatatccctacagaaaagt
attttaaagatgtaccatataatgatgttaatgcaggatatgaaactagatgtgcttttatatttgataa
attactaaataaaataaatttataagaaccgtgagataatgtgccgtaaacatataacggtaagaaggtt
cgccggggataacaggttatagtatatatagagctctaatctttatatactattggcacctccatgtcgt
ctcatcgcagccttgcaataaataatatc
>PFRP3   P.falciparum repetitive sequence DNA.
gatctgtcggaaggacagtacacagtacccaggaaatctacggattgtata
>PFRP4   Plasmodium falciparum interspersed repetitive element.
ctttactataatttgttgtttctttactacaacacacacatataattttactactttctccaatttaatt
accacttccgcgtttacttcaacatattacattgttttaccaccttgtgttcaacctcaacagtgtgttg
cactaaaggttcaaggttctccccccgggctgtttctttagcttaggggggtgaacattgtgatgtgtta
gtgtatatgtgtgtgtgtgtaaggggtactaccactagttttgtagttgttggatgtgtttttagttgtg
ttgatgttgtttgttgggttagttgtacccatttgtggtcatagtttaccaatttttaaaaatttttttt
tttttttttttccgacttttaactatcacattcatgtctccttgatgtgcttttaatgatgatatggttt
tttttaatttttatgaaaattttacaaaatcgatattttcacctacctgcaccctcatgcatggatgatg
ttgtagatgatgtcgtttttgttatactatgttgtgtgcatgatatatatgtgatgtgttgacgttgtgg
atgtgttttttatctacattatgatttacttttatgcttttgtttgcattgtgtgtttacttatatgcat
gggggtgcatttttttacttacatgatcatttttactatcatatgacttcattgagtaaatttacttctc
tttttcttctcttcttggttggactaaatggttccaaatatcaaagaaactgagaaagatgtgtgcaaag
tgcagcattaaattctttttttacaatttataacatgcacctctttgcatttaacaatcatgaacttact
aactgccaataattactacttcctaacaacatcttcctctttttcatgaactcataattatcatgtccaa
aatagttaacccatattctatttcatgtctcctttgctctctttttatcaaaacaacctcattttttgct
catctatggtcacttacgaactaatgaacacgtccaacttcaattacgaaacgtcgacttcaatactgac
aactccaaataggtctatctcatttttcatttttcatcaaaatttctattccttaattacccccaaaaca
cactcatttttacctaatcattccattatggtgcatggtagtgcatttcgtacttactttgacactacta
ttattaacatatttactcatacaacacataatcatcctctgtttattcattgaaatgcattgttttcatt
ttggctaaattttcccttgcactttccttgcacattgcatgcacttcctcgcatctaattactattactt
tgcacacacattttacacaaatctgattttcgacactactatgtaggaaaatggtccaacattccccaaa
tattactactttcccatagtaaaaatttagccatttttgaaattttccataggggggggtatttctcttt
cggccaatttttcctaaaaattttggaccattttttcaactaattgtcatgactacttcattcaaaagct
aatactgctgcatttaagtgcttcacattttcattattatgattttttagtcatcccaattttggccttc
attttcgaccaaaagacgtctttattatttgcacacagaattacatacaatacatccgaacatgtcatta
caaaacttcggttccatattttgtcttacaactcattactctcacccacaactaatatttctttgtcaaa
aaagtacttcttttatagggggaaattgaacgtgaaattcgggattttcggtcatttttttacaacgtca
tcaaaatatggtacaccaatttcgagtgttccattatatagtccatgacttactatacatacaaaatggt
agaacatacttcctactacgtttatattttgtgtgcacttcaattttccttcatagtccattttccccta
gcactttgcttgcacaattgacatgcacttcaaagcattcaattactataattttgcacacacattttta
acatgaaaatatgaattctgggtcacttactatatggtcaaatactccaattttctcttaacattactac
tttcccatagtaaaaatttacccatttttgaaatttttcataggggggggtatatcaatttttgtcaatt
tttcataaaatttttggtccattttttcacttaattgccacaactacttcaatcaaaagctaatactgct
gcatttaagtgcttgatatttctataattaccattttttggtcacccaaattttggccttgattttcgac
caaaacatctctttactattctcacacaaaattacttacaacacttccgaacatgtcattacaaaatttt
cgatccatattttatcatacaacttattactatcacccacaactaatatttcttggtcaaaatggg
>PPSAT1   P.pollicaris satellite, consensus sequence.
cggaaaacagcctaaatacgtagttttcgggtatttcagccacttttggtcagaaagtgataaaacgccc
ccaaatcatggtttttgtcatttggagtgtgctaacaccaaaaaagtcgatttatgacgggtttcggggc
gattttgcactttcac
>PPSAT2   P.pollicaris satellite, consensus sequence.
caggtccggacctgcaaaaaaagttgagttttgggccccgaaattttttgggctgtttttggcggttttc
ggcaggtccggacctg
>PPSAT3   P.pollicaris satellite, consensus sequence.
caggtccggacctgtgagatttcgccaaaaatttggggtttcgacacgggaaatttttcgggccagaaaa
gtcgacaggtccggacctg
>PRSAT1   P.ratzeburgii satellite repeat sequence.
gaatccgaaacaaaatcgttccttaaatacgaaatgcgaatgatttaagaacgtttgcagagaaatctgg
ctgatacattcgctaatttttaaaattaagcagtaaaatgtaaagtttgcatggtttcagctgtatttaa
ga
>PST1   S.scalaris Pst-1 major satellite family unit.
ctgcaggtgcagtgtgcagcctggtaaacgtaaaataataaattacattgtctaagaggactagagccgt
ttaattgtgtatatatcgtgttttgtgcatttccatggaaacgacttattgtcatttctaacttctaaaa
gcatggatactagtgccatacaggagag
>R1   R1 repeat family.
[encoded data, 5112 characters]
gcttcggtcctaataaccgcaaggttggtgggaccatgggaggtggtgggaa
>RSAI   G.morsitans centralis RsaI repetitive sequence.
actacaggtccatgacaaactcgcccaatgtgctgcacgtagcatttgatgaaccacagcaagctattag
aatgcgcggtatgctaaatgttgcttttgatacagaacaacgatttcagaatttgttgtaacggctctca
gcaccacacgt
>RT1   Anopheles gambiae RT1 retroposon.
[encoded data, 8094 characters]
cttttcgatgtaacatacgatcaataaaaatccactcgatataaaaaaaaaaaaaaa
>SCAI_EH   E.histolytica ScaI repeat.
tttaatgaaaagtactaaatacaaagtacaataatttctaattgtgaaaatcaaaggaattattcaaaat
ggtcgtcgtatagatgaaataattttttactaatttacaccgttgatt
>SGALPHA   Alpha repetitive DNA.
aagcttctaagttaaagcaatagccagtaagaagtagtacaattcaagttttagttgtcgattattcact
ttttagccggctttggtggcttggacatgacctaggaccttaagattttgcatgaaaggaggactagcag
ccgcgtggcacgggagaatgtgaaaagtgttcatatgtagtaaaaacctgagaaatccgtccgttttcgt
catttttttatcgaatcgacttaaagccagatcgtcacattggccgcttttgtctctgagatggttacat
ttatcgtctgcaaagctatatcgcgtgcagcgctatggggagacactaaaagcaccatagtagaaaacag
aagaagctt
>SGRP1   S.gregaria repetitive element.
attcttctgtaacaccacatttcgaaagcttctattcccctagacttagaactgcttaaacctaactaac
acaaggacagcacacacatccatgcccggggcaggcttcgaacctgcgaccgtagcagcagcgcgggttc
ggactgaagggcctagaaccgctcgcccacagcggccggccatcctggtaaca
>SK   SK repeat family.
cggtttagctcagtcggtagagcatccgcctcgtaacgacaaggttccgggttcgataccggttcccgcc
aactcagcgtatgagtagcacggcttggatctgtgcggtaaagtggggagctgatggtaggagtggcgct
ccacctcagacgcaaaaaacaatatccctggtctagcgctagcgaaaagggaatatactacctcgctgtt
cggctgataccgacaatacgccacttcgcctacgtctaatttactt
>SP2109AA   S.purpuratus 2109A repeat element.
ggatcaggatttgtaactctcctacatcagctctatgttgccaacctctcgatgaagctattgctgcaaa
ctctttgagtgtagcattccaactttgaaacaggggggcatttcacaaaacttatcatcagtgacaaatg
acagttttttttataagctaccggtactgaaatccttgcttatgactggttatcagcagatttgtttctg
atttttgtcatttttcattgaaaaaaaggctttgtgaaacgggtccttggtttactaaaggag
>SP2109AB   S.purpuratus 2109A repeat element.
agcaaaagtagagtaatgtccaagctgaggccgtgaatttttctgcaaagcatttaacactgatttaagg
cccctctggtccttatgtattgattaactacatgtatatttattcatttgagtagaaaaaaaactgtaaa
ataacatgcataagtgatggacgtctgaatatttaaacattttgtaaatagtgctagtttgtg
>SPEC1   S.purpuratus spec1 repetitive sequence.
tataaagcacatgtatagatgcaattgttaaaacaatgattacataacacttgcaagaatacattcaaag
ataaaattactaagatattatgacaaaaaccctctcaatctggacctctaggaagatcagagccattcaa
taatttaacggtccttaatagagctattcatccgtatttattttaaataattatatttgtttatgttcat
gggcatgtaatatgtttgtttaaacggaaaatgaaaccaaaccaatctagagcccggcactaacgtcctt
tggcaaggcattaattcacatttaccactctccacccaggtgtataaatgggtacctagcaattgatggg
gtaatgataaatgcagggcccgcaggacagcagtattgatactgatgttcgctagcctgagtttaaaaaa
atattattatcattattaatagtagtagtagtagaagtactagtattttatt
>SPRP1   S.purpuratus repetitive sequence  (clone lambda-2109B-18).
tcgagtgtataaactgtgttgttatcagtggcgtcgatcgctcgacgtttcattaaattattagagaaag
aagacgattcgttgtactgttttcgactcctaatccttgtctgaataaagtttcccccctcccgcgcgaa
acgcggaagctttggcgtttcatttgattataactcttaatccttgtttg
>SPRP2   S.purpuratus histone H1-H4 spacer repeat.
cggacgacccgggactgtctcctcccacgtacgcaacaatgccttatattgatggcgttgccgagcctca
accggattgcagcgagtattgttacaccattgcggacttgggtgacgagattcggcatcattcggtatgc
gggactggagtgcggagactccccattcgagtgcgccccctcgtggcgagtattcgctagcattattaca
tgcatttatgtagagaggcctgtgttgaatgctcgag
>SU7N33   repetitive sequence.
tcaagttcaagttcaagttcgtttatttacactcatcattaaaaatacaagaacatatacaatcaaatac
ggaataatcacacataaaatatcatacattcaataacaacaaaataacataacataatgggagtgaaggg
atgagctaaaaaggagtatggtccttatgttagagttcattccttagtataatat
>SURF1   S.purpuratus retroposon-like DNA sequence SURF 1-1.
cagatataagtattatatctcgcaattcgcatttcattcgcatatatggatatgggtttcgtatagtctc
cgggctgtggttcgcggttcgagtccctccgcgacactaatgtcctttggcacgacaacaaattaaatgt
gttactctccacccaggtgtattaaattacctggtaggaattgtattccttgaatacctttacatcttag
ggtagctgggctaaagcagggtaataatactactttgtataggcgcccttgggcatattctgggatggat
acgtgcgcaatataaatgtagctagtattgttattattattatcattattacc
>T2   S.mansoni retroposon-like repetitive element t-2.
aatttcaacttcacaccattgcacaagcaagtggctatcaaaactcagtggctgagtggacaacgcgatg
gcgtttgaagcgaaagctactgggttcgagtcccagagtgaacatcaacactgagatgcaggtacatcca
actgaccagtcggaaattggacgaaacgcgcgtcctggattccactgctagccaccatccatctttgctt
accatgcttgtgaatttaggctatatcgaggcaatacgcacagtatgcacatatgacaattacagactga
ccggttgcagtcctaaacacatcaataggaagatccaaacaaacaatactaagta
>TAQI_CC   C.captiva TaqI repetitive sequence.
gatgtgcgcattctatgtactattgcctgtggtttgctttattacttattttaacgctcaactcgccttt
tttcattacattggcattaaatggagtgtatattatgaaaattgagagataaaaatacttagaagggctg
ccactggaacagtggttcactgcatagttc
>TBKIN1   T.brucei kinetoplast closed minicircle repetitive sequence.
cagaaaacagtataattttagtagtataggataaaatatctacagaaatatggcaaggtggttagaggaa
aagaaatatgataatagataagaattagaattttatagttatatatgatagtaaataaaacaaacagtgt
atatggtctcagagatattgtataattatggtgatttatagttattaattattgtaatatatttattatt
atattttaagccaagggagataaaaatgatagaattagtatggagtaagttgggtgaggatgggagttgt
aattgtaatattgaagttaagaagatgtaggtaaagttaggtaaagttaggtaaagttaggtaaagttag
gtaaagttagagggtggtatatgaaaagttgaagttagaacgtaatagataaaactattgaaaatggtga
aaatggtgaaaaaatagcgatttctgagctcgaaaaaaccgaaaatcttatgggcgtgcagatttcacca
tacacaaatcccgtgctattttggggggtttttgaggtccgaggtacttcgaaaggggttggtgtaatac
tcacacggtttttcctcgagattttcatgattttggtgtttgtgggtttcgagactagatgtttgtgatt
ttaatttgagatttatcctatgaaaagaaatgagataatagatagacttgaagtaattatagataatatc
attgtatatatattaacaaataagccattaacaggtagatgaagtgtatatatagattataaattttata
tattatttatgtatatatttattatattattttttattatagggagataggaggtgatttgatcttggtg
agataagagaaatgggataatagatacgatataaaagatattataattaatcatagtatatatactgggt
aatcatggatttatgtagtgagataaagtgagtaaataactataaaataaagtaaattaatatactatta
tattcttttatttatatagggctg
>TBRP1   T.borreli repeat sequence.
aacttacgctataaaagtcacagtttctgtactatattggtattagaagctttccggattcatttctgga
caatttttttataagatcttcggatctttttttttgtccatttttttattttttccgaaaaagggagtac
gacactttgggggttcccaagccatcactgacctctgttcttattaattattatgtacgtgataagtttg
gcgttatatctatcaagaaacacatttattttacctttttattgattctttcactttttcacggcgttta
cacggaaaaccgtgattggggggaaagggcggtaaaacgacaaaaatccctttaaaaacccgttaataaa
gcatataataagcttattttgcaaaaaaggtggtttggaaggtcaaaaagtatcccaacttttcaaaaaa
acaacaaccacccaatgacaaccacaataatcccactataaactacacgcaaatgggaaaaccctacttt
ttttaaatacgtaatttttactataatgtcccctactccctggcccctaggggcaaagcacaccaaaccc
ctttccaccaatagcggccaagcatgctataggtgcatcagggggcatttgcgggtgaccttatcacccc
cccagcccttttacaccaccacatcgacccaaaaattcaacaattcctcaccccaaaaaccccccttaga
acccaaggggactttggaggcttcaaaaagtcccccgaggctctggagcccgcaaacatatagtcgctcg
aaaaaaaaacactacagttctttc
>TBSAT1   T.brucei satellite dna.
ctaataaatggttcttatacgaatgaatattaaacaatgcgcagttaacgctattatacacaataacttt
taatgtgtgcaatattaattacaagtgtgcaacattaaatacaagtgtgtaacattaatttgcaagtttg
caacgctgttctttagtgtttaatgtgtgcaacaaag
>TBVSG   T.brucei repetitive sequence.
acggcttgygcacaggcccctttgtttcccataggtctaccgacacatttctggcacgacagtaaaatat
ggcaagtgtctcaaaactgcctgtacagcttatttttgggacacagccatgctttcaactaacgctatta
ttagaacagtttctgtactatattggtatgagaagctcccartrrcagctg
>TCB1   Caenorhabditis briggsae TCb1(#5) repetitive element.
cagtactggccataaagaatgcgacaacttgttttttgacgataactttttgaaaactcaacttttcaac
tcgaattttttactgtagacacattggaaagttacgaaaacttgcgtacttggaaattgcatcatcttgc
aaacaaaattttttttcaattgttttcattttttttttcattttgcatatttttcatgatttttggtttt
tttaaataaagttgaaagacaactaattggaattagttttagttgattattttattgtttttcagatatg
gttagaccattcggaaaaaatccttctctgtggacgagcgaaaaagcattgtgcgtggtcatgaactcgg
cgcgcatccgaagatacttgcaactcagtttagttgttcttccagccaaatttaccgtattctgaagaaa
aatcgagatgatgtgaggtttcaatcagctttctcaactaaatttaacaatttagaatggcgttgttcat
cgccaatctccaggaagaccccgaaccacttccagaaatatggatcggaacattttgcgcgcatgccgag
aagatcctagacgcacatctacgggtattcaactttctgtgacgtctccaaatgaaccggtaccatcgag
aagaactattagaagacgtttgcaagttgctggactgcacggacgaagaccagtcaaaaaaccactcgtc
agtttgaaaaaccgaaaagctcgcgttgaatgggctaaacagcacttgtcctggggcccccgtgagtggg
caaatcacatctggagcgatgaatcgaagttcaatatgttcgtgaattttcgaaaaaaattaattttcaa
aaaaattgtagcagaatattaaaaccaacttagcctaaaagtttttgatagtgctgaaaaaatcttacca
aaaattcggattgaaaagttgagttttcaaaaagttatcttcaaaaaacaagttgtcgcattctttatgg
ccagtactg
>TCKIN2   T.cruzi kinetoplast minicircle DNA, clone pTc-21.
tggtttttgggaggggcgttcaacttttggggcggaaattcatgcatctcccccgtacattattttggcc
aaaatcctaatttttcggggaggtggggttcgattggggttggtgtaatata
>TCORP1   Trichostrongylus colubriformis DNA repeat regions.
aaattcatatctcgcgtcgcagtagagctgggaccctgaatgtttaaagtgatagagggggtggtaaggg
aacatcaatggtgggggaacggaagtgatagcaactgataagggctgataaggagcctcgagtggctaat
gggcgggtaaattcatatctcgccgtcgcagtggagctgggaccctgaatttttgaag
>TCRP1   T.cruzi antigen DNA repetitive element.
agcatgaatgcccgcgcacaggagctggcgcgcgagaagaagcttgccgaccgcgcgttccttgaccaga
agccggagggcgtgccgctgcgagagctgccgctcgacgacgacagcgactttgttgcgatggagcagga
gcgcagacagcagctcgagaaggacccgcgcaggaacgcgaaggagattgctgcgcttgaggag
>TCRP2   T.cruzi antigen DNA repetitive sequence.
gccttgccgcaggaagagcaagaggatgtggggccgcgccacgttgatcccgaccacttccgctcgacga
ctcaagacgcgtacaggcccgttgatccctcggcgtacaagcgc
>TCRP3   T.cruzi ribosomal intergenic spacer repeat.
gtcggagcagggacagcagaaagggagcaatggtgcggggtgctggcggcgcatccacccagcgacgtct
accgccgcggcttcttcaggacaggagcccgtaaagcagctaacatctggaacctctcccagtggaaaca
aaaat
>TCRP4   T.cruzi ribosomal intergenic spacer repeat.
gacaagatgaaagtatgagggaaagatggcaacgcataacatcaataatatgcttgtgttga
>TCSAT1   T.cruzi satellite dna.
ctcgcgaaattcctccaagcagcggatagttcagggttgtttggtgtccagtgtgtgaacacgcaaacag
ayattgacagagagtgcctctgactcccrccattcacaatcgcgaaacaaaaatttggaccacaacgtgt
grtgcagcggccgctcgaaaacgatccgccgagtgcagcacccgtgtgggcaagag
>TEC1   E.crassus Tec1 transposon-like element.
tttgtagtacgattagagagaatttgctggaaatgataaagtctggcgcagacttattcaccaatgttat
aaatcatgcattagttagccttagcatggtctatggatatcatgtggatagtagttagtggtctaggcta
acctgcccatatggagtccagacgatcgctacaggcttaggaggttgtccattgaaatacctcatattta
ggattattacatgtaaatctaggataatttgctatcgaattttcagcaaagtcctttgtaaatagagaat
ttgtaaatatccattaggctataattcgccaagccagttgctctaaggcatgagattggcatagtcagat
agtctgaagagttctctacaatatagactaatatggtcatcttaaagtcgccatgaacctggaaggggtt
ggggttgaccaaaataaagtcagcgcgcaggcaaaccagagagctatttagaggctatttggcataattc
attagagtttggtaatattttgaggatagtaaagggtttaaaaagacaaattaagtgatgatcataagga
tgcaaaatgaaagcttgtttatgtggaaacttaataaggtgagaaaggtagatagaaagagtattattta
agattaaattgttcaattattaattataattattaatttatattgtttcaatataaaactccctctat
>TEC2   Euplotes crassus transposon-like element Tec2-1.
[encoded data, 5396 characters]
tccctcta
>TECTH1   C. thummi DNA transposable element TECth1.
caaggccatagaactccttgcactatgtctacaatcactacttttttactcaactttataaatttttact
tatgtttcagtacacttactatacaatgtatcacaatcactgcaattactaaactttactgcacttaact
cttttttactactctttactttacttaagtacattaacctatactttactacactttcctttactttact
ttactttagtatacttaagtacattttgcttaactttactaccctttactacactttatgcactttactc
gtacttttctgtactttatttttaatcaaattaattagtgcataatttcaatctaaatagttataggcct
cttaaacatgtggtccattaatacgttgtaatcatactttcaaaaaacaaaaaataaaataaaagatttt
gcaatcattataaaaatttaaaagaaaatgtttaaaaacttaactaaaggttatagaatttaaaatatta
tttttttatttttttattattctatcattttaaaccatatttagctgatggaaaagaaagagcttacaaa
aacataaagcactaatgctactaaggcagaaatagtttcattcatgtcaaagaaatttctaattgatacc
tttagtttgtaaggaaatttgtcaaaaataaaataaaagtatagtatagaaaaatcgaaaaatttaaaaa
aaaatctaaaatgttgtgcttttgtttttaaaaatgagtaattttaattgaaaaaatttttaaaaaatta
tgaaaaattttaattcgaattgactcgaatttgattttttcacgtaagcttatattaaaaaaactaatga
ggacgatttgtgttaagtttaaatttttaaaaaaagctataaatacaagcttcatataaattagtttcaa
tttatttgcatttcgaaattgaatgaagggactgtagaaaaacaatattttaaatttattttgtaataat
atgttggctttttatttcaacaagattaactttccaaaaaaaactttttaaaaatatatatcaaaagtgt
tgataacatttaattttttctaaaaccaacaatatcaaaaacattgattctcactattctttcgttacta
ttcttcgtaattaggaaggcatccttaatgttgaaatatttgaatttagttcaatagttttattttttac
atgagaaaagcttcatttatatttacattttaaatatattttatatataaaatttcaaataataagcggt
tcttaagttgcgataatattgactatttataaataaattgaatggtaaaataaacattacttcaaaatta
attcaaaatcaactttaaacattttggtttttaaagttttaaacagttttatgttgctgcactttctata
cttttactacacttgctatactctcactatactgactatacttttacaacactttactacacttaaacta
cacttgctacacttttgctacactttgctacattctactatgctttggttaactttgcttcactttacaa
tatttaactatactttgctcatgttaacttaattttgcgcaatagtttgtatacgttactgcacaatgct
cactcacgggtatactattttgggagttctatggccttg
>TGRP1   T.gondii repeat region.
gtcgacattcgtgccacagcgacgtcggacctctggttgtcacctgcggcggaacctagacatcgctaca
ccgcccacacagcgcttccgacgcgagccgacaaaccctcaacacgtaacctccatcacgtgtagtctct
gcatggcctgacgtccgagtcgaaatacgagatcggcactctcattctcgctcactgtcgcttcctgtca
acgagcagccacgccggaaaaccacctgccaatccacacagcgaagacttctcacccggccctctatcca
ccaccccccacgacctcatcccaccccgcaacctgtggtgtcgccaaacgcaacacgtcggcagctcgtg
ccaaagtgccgaagacctcttggaggtggccgctccgcaaactaaacatggacatgccgccggacagtgc
ctccgctgccacctaacaacacctcctcgcggtcactccatcagcagtcgcctcggtgcatcgtggtgcc
gcagttgcctcgagacacagaaccacgccgcgagtccgtttctcttcttacctccaggttctgaacagaa
cgcccagcaatctcgcagacagactgcacaacgacacacaaccaataacttctcacccatccgcgcaggt
acgcgacgaaactcatacgggaaaaaggcaggaccgtgtggggctgccacacgccacaagcggcgtattc
cgaaacgagtgaactcggatcgttcgcttccgcaactggattggcccacgcatcccacgccggacactca
ctctctgcaggattccgacaacacgtcatcgaggtgcgggaacaagttgtcctttctccacggggtcgta
ttcgcctctgaagataaaagatgctacatcgctctcccttatactcccttcctgtacaccgttgccacgg
cgtgaaagcactggacattgacacagcctgcagcaggctatacagcgataatatcttacaacgcacccca
gactgttacaacctcctgacatctgtggcgccaccaaacgcaacacgtcgac
>TMSATE1   T.molitor satellite repeat E1.
gaattctgtaattcttgcgtcgttttacttcgaaatgtacaagttccacgacgaaattccgattcgcact
tagtttttcgtgattctacacagttgcgagcgaaaaaacgtatttagaggaaagttagcgtcttggaaac
ag
>TPRP1   T.parva repetitive element.
gtccttgtaggaatgggtctggtctactgcatatatcctgccatagctcctggaatgattgttccatttt
acctcattgataagattgagatggttctgttgatagctaccatatttccagctctgtatgtagcaattgc
cagaagtggtaaactgataccaggttttggtggtttctttgatcccgtgtctcctacatgtaattgggga
gccaccaataaacctgtttggctaccaagtgatttaggcactggataccactggcacctaactgacctag
tgattcccaccatgatcattttagcctatttatttatttactcactgcattacagagactcatcagttgc
cagatcaatcatcaaccaacccaaaatgtctacatgtctaaccattctattctatatgtgtcatgagatc
tcattggctgtaggatttccaggtatctttggtggtaatggaggtggtagcatcttagccctaacggcac
agctgataggtgcatttctgatgtgtctgttagctccatattctgaaggttacattattgagtataagag
acatgatcctagcaattggcctacagcaggaatgactaggtggaatgcccttaggtactggac
>TSRP1   Trichinella spiralis repetitive DNA.
gaattctgaattgcaggttcgatgtctgacctttaaaacaacctcctcgatggattattcttcatgatat
tgcaacttctatgggttagctaatgtcttctattctgctactgctaacacttcgacgaatatttctttag
gattcttcttgcagaacagtgcgaatcatttgattatatcgattttaataaatgaaaagcttgtaaagcg
gtggtgcgtattccattcttgagccacaccattaatgtgattggctatttattttgcaacctattttatc
gaatttcatctctcaattttacacattcatacctatgcttttccaccgggaatggtattaatcgcttcac
cgccatgtctgtaacaccagtaaatactcgtgaagctttgctaatcattgcatttcacagcgccctaacg
aatatgagcggtttgtcgatgtgtaaactataataagggttcttcttaccaattttccggatttgtacct
gtgtttctccgcacacatgtttggtaatggttcctctctatggaatgtaatactctctaatatagtcgag
cattgttaatcattccatttcagagcgctccaaggaatatacacggtcaatcggtacacaaactctggta
agcagttactcttaccaatattgcggatttctaccagtgtttctccccacagatgtcaggtaatgttgcc
tctctatggcctgctatactttctaagataggtaaacatgttaatctttgcatttcatttcagacagcac
caaggaatatgagcggttgttcggtatgcaaactctggagagtaattcctgactcttcctgtgtttctac
gctcagaaatcagctaatgttcctttgtattgtctgtaacagcagctgacatgtcaaagccatgttaatc
aatttcattttacttcaccaccaaaagcatgatcaatcattcgttattcaccatcttgaatgctttttcc
tgcagggatcttcggcacgtatgacttgttattccacagaaaataattatgatcgtatgactgcagtgac
gagaatttcagcttcactgcacagcagttgtaatacagcctgttacattttaaaatcgacagttactacc
cacttgcagttcgttttatcattggtaatattacagaacttgaaaatcattaatgtctactgtaagatta
ctgtattttaaaaatagaattatttatgaaaaataataccattttgtgtatttgattaaattgcttatag
ttgatatattgcaattgttacagtgtctagagtaaaaattccatgtaaccaaacgacagttttcgtttcg
tttaaaatcaactgtttgcgtcagatacttcgtattggatgaagattgtgcagtttttgattcagtcaga
ttttacgcttaaatagtcaccttaattgatttttctatagtgtgcagttgatgcggtttaaaaaaggaac
cagtataataccaaaaaacatgatttgatcagtatgatctgcaagaaaaacgttgattcgtgatatgatc
gttcatgtagtttgagttgaagctacttcaattatcacgcagtgtatgaacgacattccccgcacctgaa
ttc
>TU1   S.purpuratus transposable element TU1 fragment.
ggttccatgacacatgctccgccgacgattgctccgccgacatttactccgcaaaacgcgacaattgctc
cgcgacatttgctccgcgacatttgctccgacgtcaaatgctccgccgacagttgctccgccgacagttg
ctccgccgacaattgctccgccgacaattgctccgcctgaagcgacaattgctccgccgacatttgctcc
gccgacaattgctccgccgacatttgctccgccgaagcgcacctgctccgccgacatttgctccgccgac
aatgctccgccgacaacgctccgcctgaagcgacaatgctccgccgactgctccgcctgaagcgacaatg
ctccgccgacattgctccgccgacaattgctccgacgacatgctccgcatgaagcgacacttgcaccggg
tgacatttgctccgcgacatttgctccgcccaaaaagtgtcccattaaatacaaatgctactagtactac
gacaaatgcttcgccgacaatatttttttttcacgggttgtttttgtttctttctttttttcttcatttt
ttgaatgcatttcatgacattatgtaaatgaaatgaaatgaatgaatgttgataatgtgggaggaaaagc
agtttgcctaaaagtcatttcgaatatactgaaataactttccatctatcactgtacgtcccacataata
aacactaaacactcattacatgtcatgggaagtttttttttttaaagttagagcagctaagccacatccc
ccgtg
>TVSAT1   T.vivax satellite repeat DNA.
ccttcttcaggttggtgttctggtggcctgttgccccccacccgctcccagaccatatggtcctgagtgc
tccatgtgccacgttggcacgctccactgtctagcgtgacgcgatggcccgtgcactgtcccgcacccct
tccccactccctcttgcacctctcgctccggcca
>W1   S.mansoni female-specific DNA repeat W1.
gaattcgttcaacacagtgaaattcttccttcacacatatctaccatccaatgtcttcgcaatattttgg
agtgaaatttgcttttctcattatattgtgcatgatgactgatgtgacaggaatgaggattatgttgata
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>R1_SC   transcriptase gene, 3' end.
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>R2_BM   Bombyx mori rDNA insertion element R2 (typeII), complete cds.
[encoded data, 4260 characters]
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>T1_AG   Anopheles gambiae T1 retroposon.
[encoded data, 4686 characters]
gaaatgaaatgaaa
>R4_AL   element R4 in 26S rDNA, complete sequence.
[encoded data, 4753 characters]
>R4_HC   large subunit rRNA genes of nematodes.
tttacatggacgacgtaagctcgggaagtacgctgtaaacagcaatctacctgaggagactggaccggat
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>L1_TC   T.cruzi mRNA for Non-LTR retrotransposon.
[encoded data, 5041 characters]
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>HITCHHIKER   transposon Hitchhiker.
gggccctcgcccacggcgactttttgtagcgatgcagtcccgcgtttagcaaacgcgcgacggcatcact
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>LTRTED   californica nuclear polyhedrosis virus.
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>TED   californica nuclear polyhedrosis virus.
[encoded data, 7029 characters]
tggtcaaaaatagttgctgatctatgggtggagg
>WUKONG   Wukong, Miniature Inverted-repeat Transposable Element in mosquito.
ctgcccataactgcataacagtcacattcgacatttttgacaaaatggagttaataccatggagagtcat
ccaatgataaatacttccgatcaacttaatgaaatctgtgagattgttctagaaaattcgaaaaaaatac
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ctgcaatgaaatgtacacttggtattccatttactcagtgcctacttttgtcgaatgttacaaatatgca
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>WUNENG   Mosquito miniature inverted-repeat transposable element Wuneng.
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>WUJIN   Mosquito miniature inverted-repeat transposable element Wujin.
cagtgaaacctccatgagtcgatattgaagggaccatcgactcatggaaatatcgagtcatggaacagca
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>QUETZAL   Quetzal, a DNA transposon of the Tc1 superfamily.
cacttctccacaaaagtgaatacacagcaaacagttttaggaataaatgcctctagttgtgcatagaccg
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ttgcacggcgctcagggcaaaagctacacagaaattgcaatgttaacaaacattaatagaaatactgtcg
ctagggtcatccagcggtacaaatacgagggccgtgtatctaatttacctagaaagggtcggccctcggt
gtgcactgatcgtatgcgacgggcgataaaacgattggtggatgctgaaccagaaatcagtgctcaatct
gtagctatagtacttaacgaaaggcacggtattgccatttcatgtgagacagtgcggcggtacattcata
aatttggctacaaggcttacaacaggcgcaaaaaacctcagatcagccctatcaatcggaaacggcgatt
agaatttgcgaaaaaatacgttaaccacccacccgagttttggaaaaaagttttatttacagacgagagt
aaatttaacattttcgggtgggatggcacaataaaggtttggcggccacccggagaaggcctgaacccta
aatacacagccaagacggtaaaacataacggagggggtgtgctagtttgggggtgtatggcggcaaatgg
tgttggaaatttgcaagttatagatggaattatggaccaatatgtttatatcaacattttaaagcaaaat
ttaggaccaagtttggaaaaattagggatgtctcaagattattggttccaacaagacaatgatccaaaac
acacggcattcaattcacggctatttttgttgtacaacactccccaccagctaaaatcaccgccccaaag
tcccgacttgaacccaatagaacatgcttgggaattacttgaacgaaaaattcgtcaaacacgaattaaa
aaccgtgtcgatctagaaaacaaattaaaagaagcgtggatcacaatttctgaagattatacgcaaaatt
tggtaaattcaatgccacgaaggttggcagaagttataaaaatgaaagggtatgctacccgatattgaaa
acgttacaaaatgtcgaaggacacgaaataaaaacgaaatacccaacgaacacctgcgctgtgtacttac
ttttgtggaacgattttgaggcatctcagcagttttccaagaatttctcggaacttcaacatcggacggc
atcgtaccaagcgtcaatcgattgcaaataggtcaaagcataattgataattttcccatatttttaattc
ggttctatgcacaactagaggcatttattcctaaaactgtttgctgtgtattcacttttgtggagaagtg

>PEGASUS   Putative HAT-like non-autonomous DNA transposon.
cagtgttgcgaacggtgatagtcgtcgacataaaatttttcaaaatgatactttttgaagcatcgcattc
tagatccacgcattcattcgacaatcacggaaaaaaatatcatttgacatgatgatattttttctgctac
aatcatttgactttttgattttgccgtacctcaagtgaactagatcttcatcgaaaatgggtcctttttt
cgtgttttcgcgtgaatttctatactcctgtaagagaataccattttcctggttcactgagtgaaaatat
caagtggtctaatggcttagtatcggtaaacgcacgattaagcagttctggattctcactgaaaaatgtc
aaatggcattcattctacattttttgcaatcatgtcatcgcaaaagcattgattgttaatgcacaaatga
ttgtcgcttttggaaagtcgtgtcatggtaaccatgaatatcatgatcaaaaaatgattttgacacccgc
ttactgcgaatatcataaaaaaatgtcgacaattaacaacactg
>MLE1_TC   Mariner-like transposon mle-1.
ggttgattcataataaatcggacaaatggtagtgatgatttctagagatcataactcagtaacgaattaa
cgaaaatggacgcgcgaggtaccgttggaatgggtatgaaaagctcttcaaagtaccggaaaataatcac
tccaaagtaaattcattccgccacaatgccgcacgatttcaagcggtccagagaccacatccgcaacgtc
atactatttatatcgctatctggccaggaacccgcggatatcggcagacgtctgatagaagttcacaagg
agcatgcccccggcagaagtacactgtagttgtagcattcgaagtttgcgtcaggcgactattccatcga
agacgaaaaccgcggttggtggagcgtacacggcgtagagtactgggagctgctcgatgaaggtaccaca
gtatccgccgacgtctacgttcgtcaattacgagaattgaaggccaatgtccaaagttcgctacggcggc
ggtcacatgtctacttccagcacgacaacgtgtctacttccacagaccgcacttcgcaagatcgaccaag
gccgagctgctgtcgtacagttggaccgtacttctatacccaccgtactccccagacctggccccttcag
atttccaccttttctcccacagtaaacgccacctggacggccaagacttcaaaactcgcgacgaggtcaa
ggcggcactcggcaacttcttcgagctccagcttccggccttctggagcaagggcatccatgatctgcct
ataccgtggcagaaggtcatcgataaagatggcgtaaatttcaagtgaatccctgttgtcgtaaaaaagt
tgtacgacaatgattaaaattggtcaatttgtccgatttattatgaatcaacc
>SR1   partial cds.
gaattcctagttgacgacctctcaatcctggctcccctggggaaaagtgatcacgccgtcttatcattca
gctttgtcagcaaaacggagctacgatatcctactagcaacaagcgctggaacttcaaacggttgaatgt
gttagctttacaggactatctacaacaggtggattgggatgttcaccctcaacttgaagtggatgctcat
tgggattttttactgcacacgatcttatgtgctactgagcattcagttcctaaaatggtcccaaaaagct
acaagcaacctccaatcatcaagaaccgcactcgtcgtttgctaagccgcaaaaggcactgttgggctga
atataaacgaacbgataacaacggcgcgtacaggcaatacaaacatataaggaacatatgbacaaaggca
ataagagaagacaggcttcagttccagaccaagcttatcgataaattcgtctccaatccgaaaagcttat
tcagttacgcagcttctcttcgacaaggcaaaactggagtttcccaactgcttggtcctaatggcccgac
caataacgacagtgatgccgctaaccttttggctgaacaatactcccagacattccagctgacccacatc
aaccatactgacgaaagcttcacctgcacctgtacaggactttccgaagtggatctgagtgctgacctgg
tgctccgtaaactgcagcacctaagaaaagacacttctcctggtccggatatggttcattccgctgtttt
gagggaagcagcttcaatcctggcgacaccacttagcgtgatgtttgcacactcgctaagcagaggcaaa
ctaccggaaatttggaagctggcccacatcacaccaattttcaaaggaggtcgacgcagtgaaccctcaa
gctaccgaccagtggcccttctctccataccttccaaaattatggaatccctaatatacgacggtatatt
agaatacttatcatcctcaaagttcttctcacctcaacagcatggtttcagaaaaggtcattcttgtatg
accaacctgctgactgcggtggatagatggacaaccatccttgatcgcaaggggaaggttgacgtcatct
acctggacttctcaaaagcttttgatagggtcaaccatatatgtcttatcaagaagcttagacgattggg
tataaaaccccctttgattgattggctctcttcatatttagaaaaccgacactttaaggtcagggttaac
ttcactctctctcaggctatggaatgtcctagtggggtcccccagggctcaatactaggacctcttctct
tcttgatttacattaacgatcttcctcaacaagtttcatctgacttattgctttttgctgatgatgtgaa
actttggagagagatacgtaatcataatgatatactagttcttcaggaggatctgacccgacttcaaagt
tgggcagacgacaacggacttaccttcaacacttcaaagtgcaaagtagtccatctgagacatgttgcag
accatagttataacttaggtaactcccctctagaagtttcccaagtcgaaaaagatttaggagtgttggt
accctatgacctgaaatcgtatgcgaactgtgacaaaaacgcctttcaagcaaaccttgcactggtaaca
ttgaagcgcatttttggccagtttgacggtagaaccttccacataatcttcaacagttttattcgtcccc
atttagagtacggaaacatagtatttcctccctccctccaaaaggataaggacactctggaacgtataca
acgtcgagccacgaaatcagttcggggactcaaattcaaaccttacgaagagcgcctccaatcacttaac
ctttacccgttagagtacaggcgtcttagaggtgaccttcttatgacttacagtatccttaatacttctg
gtcatccccttaaacatcttcttaagcttagtcataacactaacctmagaggtaacacccagaaattgga
gaccctatatagcagaacagactgcagacacaacttctactccgttagagttgtcaagtgctggaattcg
ctgccgactgagctagtccaagcgacctcccaggagtcctttaagaggaaacttgacttattcttaagga
ctaaggataacatattattatgatttaccaaattctttttttccctctattatcgttcatatacctaggt
ttttgcctggaggtattggtgatccactgctactagacacggaagcccgttaagcgaaagcttcttctat
tccatcctcaaccatttgaaccatttg
>TAS_I   Retrovirus-like element TAS; an internal sequence.
[encoded data, 7171 characters]
tcgatcggatgcggttcgaatcagttatcattgggcgcaaggatcgtcgcctcgggag
>TAS_LTR   Long terminal repeat from retrovirus-like element TAS.
tgtcgcgtcaaatggcgaaacattcaaaacaaaattccagcgaaatgatcaagaagatttcgctgagatt
ttgtgagaaaggaaacataaaatcctcacttgtgagaggattttatgtctcctcctttgttatcattctt
tgtaaacgtatttaactctcgtcgtctcttagtctacgcctctttcaaaaggtgcttaggggacctccct
cttcttctttcccacatatttttgccgcgtttttacgcgaca
>ZEBEDEE   A.aegypti DNA, copia-like transposable element Zebedee.
cttcgttgtctcggtcatatcagtgaaagtggaatggcctctctggtgcgtgagaacctggcccttggtg
tgcgtttcaagccggagaagattaagttctgcgatgtgtgtgtcccggaaaaacacagccgggacccgtt
cgatggtgcaagagaccgggcgaccagatcgttggagcgtatccattcggacgtgtgtgggccgattgag
cctgcatcctgggaaggtcatcgctatctggtctcgttcattgatgactagggtaacggtcgtattttgg
accccctaaggaagtgattttagttttttgtcccaattaattaattgcacagcgtaaccaagtcaaagaa
catgccaaaatgtagagaaaaacttctcctacgagataaaaatgcccctacgatcatgaaggatccaaaa
aatgtcgaaaataattgaattgtgaagaactgtttctcattattttggacacaccaatatattttggacc
cctggaatttttttatcgtttggcgaaaagtccacgacactggttgtataatatgctcgcccatagtcta
atcaatcgattgacattggaaaaccgaagaaattctacgcttttagtgcagaaatttgaaaaacgttctt
gtttacatttaaaaaaattctgacggcttcaatttctgtgtgtaacgttttgtaacggttgcatggatga
accgattaaattaaattaatttcagataaaataaacacaatttctatgtataaacggttgatgcaaatgc
ggaatagtcctatctttccaaatggcatgcgaattgagttgaaggaaggaaattgaagcgatggcgactg
cggcttgtggcacgaagatttcaaaactgaccgtagaccagggacgtgagtacttctcaaccagccagaa
gaactactacaaagcgaaggggattcaggtcgagccaactatagcctactctccgcaacaaaatgaagtg
gcggagagattcaacaggaccctaatcgagaaggtacgtaccatgcaaattgaatctcatgctccaaaat
cgttctggtgtgaagcggtgctgtcggccgtgttcctgatcaatcggagcccaacctcggctgttttaag
aaacgttacgcctgctgaactatggtacggtcggaagccaagtctggagaaggcgcgcgtttttggttgt
caagtctatgcctggataccgatcaacggaggaagaagtcggacacgaagagtcgacagctgatcatggt
tggttacgcgcccaatggctaccggctgtgggacaaggacgagaggagaatcgtaattgctcgtgacgtc
aagttcaatgaaaactactttccgtgggccaacaatgcaagagatcgcgcggaagagagactggtggtac
ccttggtctacgagcaagagggggaagaacatgccaaggaagccattgatgaggacgccatccaacctga
tgatgcggcggtcggtccgttcgacccgtccgaccacgaaggcgaacttctaaccgaggatgataccgat
gacgaagctgcgacggaactagccaaccctgcgctcccttcgcaatcagatctggacatgtcctccggcc
ctagaggcgagcagtccgagaggcgcaggaaacgggagcgccgttttccgggtaagttccttgattatct
tactggatttagagctagtgctgttggtcctccctccccttcagacgttcccgaaacatacgatgaaatc
cgtacccgtgaggaatcgtgccctctggaaccaggcggtgcaggaacgagctccgttcaatgaaggccaa
acgatgtctggaagagtggtgggcgtgcccccgccggcgtgaagctactcaaaacgaaatggtcttccga
ctcaaggagaacgaggctggacgatcggttcggcataaggcgcgactggtggtcaagggtttccttcaac
gtcctggaatcgatttcgaggacacgttcgcaccagtggctaagctgtctaccgtgcgagtggtgctagc
cgttgcggttcatcatggtttcaaggtgcaccagatagacgtaagcacagcgttcctccacggtatgctg
aaggaagatttgttcatggaagaacctgaagacgtgaaggcgaagcccggcagtgtgtgcaagctgcaga
ggtcgttgtacgggttgaagcaagcaccacgttgctggaacgaaaggttcaactcagcgcttctgaagct
gggattcagcagatcccaccgtgcctactgtctctacgtgtgcaacactgaaggggatgaagttttctta
gtgctgtacgtcgacgacctcctgatagccggacggaacattcgaacaattcagaagctgaagcgccgtc
tttccgatgagttctaaatgaccgattgcggcgacgaggtttttctttggggatgcggctcgcttacaat
ccggagcatggtgacctgaagttgacccaagaaacagctgccacgaagatcttggagaagttcgctatga
ctgaatgttaccccgccaagaatccgatggagaaaggattgcagcctgatgtatcaaatgctgtgtgcgc
ccggatttgtgctacccggtcagctacttgggaaggttccagcaatcatcaacgaacaatcactggcagg
cgctgaagcgagttgtcagatacctctaagggacggctaccctgggactactctacaagagaaacgagaa
cagcagaccgctcgtcggatacgtggacgccgactgggcatccgatgcggaagatcggaatcggtaacag
gtttcctgttcaaagtctacggcatcgacggtatcctgggctagtcggaagcagccaacagtctccatat
cgtcaagcgaggccgaatacgtcgcgctgagtgcagccgtatcggaagctatctggttgtccggaatttt
agaagacctcaactgcaagaagctgacggaccctgtatcaatatacgaagacaaccgtggctgcataggg
ctgcccaaaaatgctgaatcgaagcgcatcaagcacgtaaatatcaagcaccactttatcaaggaccatg
tggctgccgggaccatcaaaatcgaaccgatcagcacccccgagcagcaagcagacattttcacgaaggc
gttagatgtcacccggttccaatccctcaggagcaagatcggggtcaccgattgagagagggtgttagaa
atctagcactcgctgactgctggatttacatcacag
>SINE_CP1   C.pallidivittatus Cp1 (SINE transposable element), clone pCp125.
aagcttgctctgctaacagaacgacttattctcattttgaataagcatattatctctctaagcgagcgaa
tgctttacaaccgttgaaaaaagagtggttcatatatattggcattctgccaatgccaatggcaaagccc
gatagctcagtggtctgagcacttgaccggcaatcgagaggtgcgaggttcgattcccgctcgggaagag
tcattgggtgaattacttttttttcaactttttcttttaaactatttctctctaagcgaagaaatgctta
ttcaaaatgagaataagtcgttctgttagcagagcaagctt
>TFP3   transposable element derived from Trichoplusia ni after infection.
cccattcgctgccgatctaaagagtaacaatattacccagttgccgccatactgtactatgcagcccgcc
catcggcggtcccggcatcttaattatgtatttttgcccgcccattggcgttttcggcatgaaactgcag
attccgacatgaatcgtttgatatcgcatccaaaaaaatcctagaaagtgctattaatttgacttaagat
aacgcgaaccgataatataagccttcattgcttttatcagccagccctttgtattggcccggccgaccgg
cagaagtgccggccggctgtctgggacgttttaggccaaaattaaccctgccgaagggttttttttaagt
aagagacgtccaaatgttttttcttagtattttttcacaacttaatcagaactttctgttgatcaatgtt
tcgaaggttttacacctttatgtgaaatagatgataacactttatttttatacacgaaactcatgcttaa
gaagtagcgagcagagaagtttttacataacttaataatagccgttagtcgttctaaaatttacaaaagt
ttgggacctctgatataaaatcttcggcccgcccaacggcgggctcggcatgacagtatagaattgcctt
ttttcaaaacttcaaatatcagcaggccatttgagttgcaaatcaatattaataaaacaaatcattacac
attatctcattactttctgacgttatttcgtaaagttattgcagtttaaaatcaaaccgcccatgggcgg
tctcggcgtgaaagttaaaaaaatttttgcccgccgatgggcgggctcggcactgaatggg
>HECTOR   Transposase from DNA transposon Hector element, partial cds.
caatgggtcgtcgaggattgtagacctttttcagctgtcaatggatccggctttgaaaagctagtacagc
atttcataaatcttggtgctaagtatggggaaaatattgacattaaagatttgcttcccagccaaagaac
aatatcgcggaatatccaaaagacggctgaagaaacaaaaaatggaattaaaaatgaaattgcagaagtt
gtgcgaggtggtggtgcgtccgctacaatagatatgtggacggataactatgtgaagaggaattttttag
gtgtcacattacattaccaatcaaaatcaaaatttgttgatatggttttaggtatgaaatcgatggattt
ccaaagacttaaatctttatttaatgagtttggtgtgcaggatctgggaccaataaagtttgtaactgac
agaggatcaaacatattgaaagccctggaacaaaacacacgactgaactgtagcagtcatctattttcaa
atgttcttgaaaagtctttcgaagatactgcagaactcaaagaattattaaaggcatgcgcaaaattagt
taaatattttaagaaagctaatttgcagcacaaattgcctacatcattaaaaagtccatgcccgacccga
tggaactc
>IKIRARA1   Anopheles gambiae transposon Ikirara1.
cagggtttcacactttatctcaagaccgcgggaccccttcccgaatctgtcttagccaaagccaagactg
cggtatgatgcttgaaaacgttgatgatacctgaattcatcggatgcaatgctgaatctgcggcacattt
ctcgaaacacactggtccgcgccgaggacatgcggtcgaatatttttttacacggataacctttgtgtac
atcagtgtactgaaaacagttaattattttttcgtgtttttaccagaaaagattatttaaacagttcaaa
ctaatttctaaacacttgtaaatattttaattaaacaaatatgcattcactcattttattaaattgtctt
tttttggtaaaaaaacgaaaaggataattgagtgtttctaatagactgatgtacacaaaggttatccgtg
taaaaaaatattcgaccgcatgtcctcggcgcggaccagtgtgtttcgagaaatgtgccgcagattcagc
attgcatccgatgaattcaggtatcatcaacgttttcaagcatcataccgcagtcttggctttggctaag
acagattcgggaaggggtcccgcggtcttgagataaagtgtgaaaccctg
>YOYOLTR   LTR from YOYO retrotransposon.
agttaacgctgctaacatttaaaaactccaaacatatgtttcccacggtacggaaacgcacccacagcaa
caatacaggtaaaatgctgatgccatgtctgccgcgccggatcaacgtatcatatagcccgtacacgcgc
aaccatttcgccaacaccgtaaactgtcacctgtgcccgcaacgtgatacagatgcttaatgttaaggaa
gtaaaaattgtaattcagtcctaagttagaattcaataaagtaacatgtactgaaagcacagaaaaaatt
attttttttctataacttaacagtaattaagttaac
>YOYOI   env-like genes, complete cds.
[encoded data, 7166 characters]
>IFP2   Trichoplusia ni transposon IFP2.
ccctagaaagatagtctgcgtaaaattgacgcatgcattcttgaaatattgctctctctttctaaatagc
gcgaatccgtcgctgtttgcaatttaggacatctcagtcgccgcttggagctcggctgaggcgtgcttgt
caatgcggtaagtgtcactgattttgaactataacgaccgcgtgagtcaaaatgacgcatgattatcttt
tacgtgacttttaagatttaactcatacgataattaatattgttatttcatgttctacttacgtgataac
ttattatatatatattttcttgttatagatatcgtgactaatatataataaaatgggatgttctttagac
gatgagcatatcctctctgctcttctgcaaggcgatgacgagcttgttggtgaggattctgacagtgaaa
tatcagatcacgtaagtgaagacgtccagagcgatacagaagaagcgtttatagatgaggtacatgaagt
gtcagccaacgtcaagcgtagtgaaatattagacgaacaaaatgttattgaacaaccaggttcttcattg
gcttctaacagaatcttgaccttgccacagaggactattagaggtaagaataaacattgttggtcaactt
caaagtccacgagcggtagccgagtctctgcactgaacattgtcagatctcaaagaggtccgacgcgtat
gtgccgcaatatatatgacccacttttatgcttcaaactattttttactgatgagataatttcgcaaatt
gtaaaatggacaaatgctgagatatcattgaaacgtcgggaatctatgacaggtgctacatttcgtgaca
cgaatgaagatgaaatctatgctttctttggtattctggtaatgacagcagtgagaaaagataaccacat
gtccacagatgacctctttggatcgatctttgtcaatgtgtacgtctctgtaatgagtctgtggatcgtt
ttggattttttgatacgatgtcttagaatggatgacaaaagtatacggcccacacttcgagaaaacgatg
tatttactcctgttagaaaaatatgggatctctttatccatcagtgcatacaaaattacactccaggggc
tcatttgaccatagatgaacagttacttggttttagaggacggtgtccgtttaggatgtatatcccaaac
aagccaagtaagtatggaataaaatcctcatgatgtgtgacagtggtacgaagtatatgataaatggaat
gccttatttgggaagaggaacacagaccaacggagtaccactcggtgaatactacgtgaaggagttatca
aagcctgtgcacggtagttgtcgtaatattacgtgtgacaattggttcacctcaatccctttggcaaaaa
acttactacaagaaccgtataagttaaccattgtgggaaccgtgcgatcaaacaaacgcgagataccgga
agtactgaaaaacagtcgctccaggccagtgggaacatcgatgttttgttttgacggaccccttactctc
gtctcatataaaccgaagccagctaagatggtatacttattatcatcttgtgatgaggatgcttctatca
acgaaagtaccggtaaaccgcaaatggttatgtattataatcaaactaaaggcggagtggacacgctaga
ccaaatgtgttctgtgatgacctgcagtaggaagacgaataggtggcctatggcattattgtacggaatg
ataaacattgcctgcataaattcttttattatatacagccataatgtcagtagcaagggagaaaaggttc
aaagtcgcaaaaaatttatgagaaacctttacatgagcctgacgtcatcgtttatgcgtaaccgtttaga
agctcctactttgaagagatatttgcgcgataatatctctaatattttgccaaatgaagtgcctggtaca
tcagatgacagtactgaagagccagtaatgaaaaaacgtacttactgtacttactgcccctctaaaataa
ggcgaaaggcaaatgcatcgtgcaaaaaatgcaaaaaagttatttgtcgagagcataatattgatatgtg
ccaaagttgtttctggactgactaataagtataatttgtttctattatgtataagttaagctaattactt
attttataatacaacatgactgtttttaaagtacaaaataagtttatttttgtaaaagagagaatgttta
aaagttttgttactttagaagaaattttgagtttttgtttttttttaataaataaataaacataaataaa
ttgtttgttgaatttattattagtatgtaagtgtaaatataataaaacttaatatctattcaaattaata
aataaacctcgatatacagaccgataaaaacacatgcgtcaattttacgcatgattatctttaacgtacg
tcacaatatgattatctttctaggg
>BM1B   BM1B repetitive DNA element - a consensus.
ccacggtgtttcccgagcgctatgacatgtccttcttcaaacgaggcttgtggagagtattaagcggtag
gcagcggcttggctctgcccctggcattgctgaagtccatgggcgacggtaaccactcaccatcaggtgg
gccgtatgctcgtctgcctacaaaggcaataaaaaaa
>L1BM   Bombyx mori L1Bm DNA, non-LTR retrotransposon.
cgcaagcttgcatgcctgcagtccccacggtctcggcgtggaaaaagccgctgccgtatacgaaggcggg
aacggaaaccgcacccccgcccccgctcgtgacacgccccgcgcccgcgtagttccgcgtcggaactcgt
attcaaaaatcattcgaattttcgaaatattcatctttcttccgtcccccgcaaccctctgccgtcaacg
acttcgcgctcgtgcgtgacttcgtcaccgtgtctaagctgattaaaaaaagcaactgaaagtcgataat
cgaatgttgcacatttaaaacggtcaacttcgaccgtctgcgatcgttcgcagacgcgataacgtaggtc
ggtaacccccaaaaagatcctcataggttgtccacaagtccaccatttgaaaaaagtttcactcaaacca
gaacagcggctcgcggccgctttcgatcacatggacgtctacgagtccgtgtcgcgtacgtgaaggtcct
atatcagttcgaagtacctattaaattaaaacggaaatttcatactttaattataaaatcttaccggtaa
ccaatggcgcaaaaaggtagagaaaaaccgtattcccttacccctattattttgtgcgtttactaggtag
gtattcaaggcgtaattttgcaatttaattcgttagcattctataatgctaacggactcgcgcggcaacg
gattccaaatttttgaattcctccgcgataatcttgtagatattctattagtgcaggaaacctgtctgaa
gccctcgcgtcgcgacccgaaagtcgcgaattacgtcatggttaggaatgacagactcaccgcctccaaa
ggcgggactgccatttactataggcgggccctgcacgttgtccctctcgatactccctcgctctcacata
tcgaggcgtcagtgtgccgtatctcgctgacgggacaccagccgatcgtcatcgcatccgtttatctccc
cccggacaagccccttctgagcagtgacatcgagtcactgttcggcatgggagactctgtcatcctggca
ggcgatttaaattgccaccacactaggtggaactgccatcgtacaaacgttaacggtaggcgtctcgacg
cgtttatagacgacctcacctttgaaatagtcggtcccccaactccaacatgttattcgtataacatcgc
gctccgtccgagcactatagacctggcattgcttaggaacgtaactctgcgcttgcgttccatcgaaggc
aatgtcagagctcgactcagaccaccgacctgtcgttatgcagctcggtcgccctcacaacccagtcact
gttacgaggaccatggtggattggaataagctgggcacgtgcctagccgacgccgctccgccaatcctcc
cttacggcccggattcgaatccatcccccgaggacaccgtcgaatccataaacatcattaccgatcacat
ctcttccgcgatcattagatcttctaaagaagtcgatgtggaggacagcttccaaccgcatcagactgtc
ccccgatcttaggaatctcttaagagttaggaacgcggcaatctgggcctacgatcgtcttcccacgcat
tcaaaccggattcagatgcgtcgtctacaacgcgaagtccactcccgcttaagcgacgcgcgtaacgata
attggcatagttatttagaacaactcgcgccctcccaccaagcatactggcgactagctaggactcttaa
atccgaaactaccgctactatgcctcccctcttacgcccttcaggccaaccaccggcattcgatgacgat
tacaaagctgagctgctggcctaactgctgcaagagcagtgcaccaccagccctcgacacgcggaccccg
aacacaccgagttagtcgacagggaggtcgagcgcagagcttccctgccgccctcggacgcgttaccccc
cattaccacggacgaagttagagacgcgatccacaacctccaacctaggaaggcaccaggctccgacggc
atccacaaccgcgcgctaaaaattttgccagtccaactgatagcaatgttggctacaattttaaatgccg
ctatgacgcactgcatctttcccgcggtgtggaaagaagcggacggtatcggtatacataagccgggcaa
accgagaaacgaaacttctagttaccgtccgattagtctcctctcgacgataggaaaaatttacgaacgt
ctccttaggaaacgcctctgggattttgtttaccgcgaacaaaattctcattgacgaacagttcggattc
cgctcaaaacactcgtgcgtacaacaagtgcaccgcctcacgagcacattctgataggactaaataggcg
taaacaaatccgaccggcgcctcttcttcgacatcgcgaggcgttcgacaaagtctggcacaacggttta
atttacaaactgtacaacatgggagtgccagacagactcgtgctcatcatacgagacttcttgtcgaacc
gttcgtttcgatatcgagtagagggaactcgttctcgtccccgtcaactgactgccggagtcccgcaagc
tccgcgctgtccccgttattatttagtttgtatatcaatgatataccccggtctccggagacccatctag
cgctcttcgccgatgacacggctatctactactcgtgtaggaagatgtcgctgcttcatcggcgactcca
gatcgcagtagccaccatgggacagtggttccggaagtggcgaatagacatcaagcccacgaaaagcgca
gcggtgctcttcaaaaggggtcgccctccgaacatcacttcgagcatccccactccgtagtaggcgcgca
aatacctccgccgttagtcccatcactctctttggccagcccataccgtgggtctcgaaggttaaatatc
taggcgtcaccctcgacagagggatgacattccgtccccatataaaaacggtacgcgaccgcgccgcgtt
tattctaggacgactctatccaatgctttgtagtcgaagcaaactgtccctccgcaataaggtaactctc
tacaaaacttgtatacgccccgtcatgacgtatgcaagcgtagtgttcgctcactcagcccgcacccact
tgaaatcccttcaggttattcaatcacgattctgcag
>R1A_DS   partial cds.
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accgtttcacctacgaaatagttcgaggactgcatgaagctttgccaaggctgttgggtgcactgttcaa
cagatgtctttctttgaaggtattcccgaatgagtggaaaaagggtgaactagctttgctagcgaagatt
gggaaagacgtaaaccgtccaaacgcgtacaggcctatttgccttctcccggctctgggaaagatctatg
aaaagttgatcgtcaatagactctggcattttgtgacgatcaacaaagctctatcagataaccagttcgg
cttcgtcccatatcgctccactactatggctattgataaacttttggggacattccgccactttgaggat
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ccgcacgatcagcgttcgttttgggagcactcgtgttacccgcaatgttgttagaggctgcccgcaggga
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aaatccaaagccatggtcttgaacagcaagtaccgttcgcttgatcttagccaccacttagtagggggca
ttaaggtggaaaaagagttgaagtacttgggtctgatcattgactcggacttaaacttccagtcgcactt
taaggcggtcagtgcacgagtcaacagattcgtgcacaacttaagatctatgaccgttcgagcaaatggc
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tatggttccccgggcacattaaaaagttctatgatcgtttcaatgcgatccaacgatcggctctgattct
tgcgactagagcgtaccctcgtgccctactacggcattacaggcgatcagtggcatcttgccaggatctc
caaatgtggaggtctgtgtacaacacgcaactcctgcacttgcagaaggtgactatggtggatggaagaa
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tgaatggtcgaacttcggttctccgagcacggtctcggactcagataaactggctcgccaccagatctat
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gttgcaatggctgcttgcggatggtgtcggcattaagagctgtgcagtcattactgacagccaatcgtcg
ttacaggccctagccaatccttcttgtgattggctattagtaatgcgggcaaaggcagcctatcggcagc
tgctgcgaaatggagttgcagtccgtttcttttggaccaaaggacacgcgacttgcgagggcaataaaat
cgccgacagtgcggcaagagaagcctcggcttcgggactctcgatcgaggtcccccttccgcactcatac
ttcaaatccgtgacagccaagatggcctaccgcctttgggagcagcggtggcgcgcctccaatggctcca
gtgcgacgcatttgttcatagaggtacctacctctaagagttggagtaactgctcggaaatgactcaagt
tctgactaagcatgcgcagtaccccgagtacttgcacagacgtggagttattaattctccaaggtgtgta
tgcggcgagatgggctctttggaccactacctcgccgcatgcccggaaaccctttgtttccgacagaagc
tcacgtcgcgttgcagtacatacgcggacctaccgcgattgtcaggatttcctctaatttag
>R1B_DS   partial cds.
gcatacgcggatgacctgctggttctaattggcggtaacaacagagatcgactaaaagaagacgtaagct
ccatcttcacagatatcaacgattgggccctggctaacaaactaagtatcaacaaagaaaaaacaagggc
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cagcatgtaaaatatctagggatcacctacagctctgatggcacattcaaggagcaccagcgaagaatag
acagcaagataaggaagctaaacaataaaataagatcaatcaggatcggaaatcgtggattaccaggtga
aaagatgagaagaatatataagacggtgatcgagaaaattatatcatatggagccaacacttggacaaaa
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cataccgtacaacttcaactgaagccatgcaggtcatcgcgaatataacacctttagatctgattcttcg
agcagagagtaagagggcggacattctggagtgtggggggagcgccacagtctcgggcaggccgataggt
gcttcagggattgagatgcggccgcacaagtttgcgacccatcccaagaactggacgcgtgtcggctggg
ccgagtggcacgatcgggatgactatattctgcagatctatacggatggatctaagacttccgatggtac
gggggctgccttcgtggtcctggacaggggcaggcaaattttctctgccggattctctctgtccaagcat
catacccattaccaggcagaggcagtggcaattttgaaggccacgatgtggttcgcagaggaatgccaag
ggaataaagttgctattatttcagacagccagtcagcactaaaagccctatatcgcacccaggaagtttc
tcccaccattcgagacattaaaagaaccatcacaacaatcaaaagacaaggaagacaaatcgatctttat
tggacgaaaggtcacgcgggtcaagctgggaatgaaatggcagacagagcggcgaaggaggcagttattt
caggtcaacgatacgtcatgccgcgaccggtttcctgggtcaaggcactgatcaaaaaagaaactctgag
agaatgggccacaaggtgggccggctctgacaagggacgacacacacacaacatcatctctgccccgggg
tttaaggagtggatcttctccaaagaaatcactcaaatcttaacgaatcacggtaggacaccttcgtaca
tgcatcgctttggtttaacaagttctccactctgctcctgtggcggggtgggggactgggaacattactt
ctttttttgcagatcaacagaagcagtagccggagtgtccgcagattacagaacctacaacaactag
>R2_LP   Limulus polyphemus retrotransposon R2, complete sequence.
[encoded data, 4544 characters]
aataagaaatatcga
>R2_AM   Anurida maritima retrotransposon R2, complete sequence.
[encoded data, 4331 characters]
gctatag
>R2_HC   gene, partial cds.
gcgtttgcggacgacgtaatcctctgcggcaccacttcttggggactacagagaaatctggaaatcttcg
aggaggagctccgaagaagcggactttccttaaatcctgggaaaagtaagtgcgtttcccttgttgcttc
tggaagggaaaagaaggttaagctagtgatgaccccgacattcagagcgtcgggtagttggcttagccag
gtcgatgggaccaccttctggaagtacttgggattacagtttaggggttgtgggatggccggttgtggtt
cggacgatgtagctgagtgcttggagcggctcactcgtgcgccgttgaagcctcagcagcggatgcactt
gctgcgggtcttccttttgcccagattttatcacgtctggacatttggaagactcaatgcgggcatcctg
cgtcgtctggacattcgtgttcggaatgccatccggacatcggtgcgcctaccccacgacgtaccggtgg
gatacttccacgcgccgactaacgccgggggactcggtattccgcaattgtcgcgcttcattccgctgtt
gcgtcttaagaggtttgagcgtttggctcactcctccgtcgaaagcgttcgggaatgcgcgaggaccgaa
cctgccgtggcgaaggtccggtggtgtcgggagcggttagcggacgtcgtagaccgggtcgcggatggaa
cgcagagtcttcgcgaattttggacgcgtgagctttatcggtcgatggatgggagggcgcttagggagtc
tgtgagagagactccgagtacacagtggctccgctgctgtacccgtgtcataccagccagagactggctc
aattacatctccgttcacattaatgcattaccatcgcgtgttcgaacatcacgtggcagacgtgacggcg
tggatgtgacctgtaggggcggatgcttgacagctgaaacccctgctcactgcatccaggtttgtcaccg
aacccacggcgggcgggtgttgcgacacgatgccatcgcgaaggcgctgtcagtacatcttacgcagcgg
ggttggagtgttaggagagaagtctcctatcagacggttgttggagtccgacgacccgacattgtgcttc
ttgcggggcgagaaatcgccgtcgtggacgtgcaagttgtcgcacctaacccttctctggacagcgcaca
ccgcaaaaaggtcgccaagtatcgtgacgaggctcagctcgccacgtgcttggtgcgaggagcttcggta
caaccaaggaggagagcggaagaagaaacgcaagtgcgatttgccagcgcaaccatctcgtggcgaggtg
tctggtcttccgagtccgcgcggtccctgcgtgagctggggctgacggaccgggagctggcacaatacag
cacctacgacctgcgtggctcctggatgaactgggtaaggtttggtgcgtctacgtctactcggatggcg
tggcgcccgtaaaatctccaaaggtaatcgccaaaccgtttggtttctacatctgcgttcccttcaggaa
cggactcggtttcatcatttcctaa
>R2_PS   Porcellio scaber retrotransposon R2, complete sequence.
ggcaggagtaactatgactctcttgggctatctgtaaggacattgcgtacttgcggagcactcaagtgat
taatagattactgatagaagcgttcccaacagtcccgctggatactgtctatttttgtggaactcaagta
ggctagggtcagccctagttgtacgggttcaccaggggtaggccgtgctaacttctatccccgttagtga
ccgagagcttcgaaaaagcaacgctagatcaccagcagcccccggggggaattaaccgatcgggggtctc
ttggtcacgtatcggaatggcggagcgaatggttagttgtgtcgtttgccgaagggaatttcgaacggcc
agggggcttggcgtccatatgcagagggcccaccgcgaagaatacgatcaacgcgtgggccaggaggctg
tggacgtcaaggtccgctggtcgaatgaggaaaccatcctcctcgcttcgaaggagcttgagctgcaggg
ccagggaattcaaaatctgaatcaggaattggctcgtctctttcccagatcgctctaagcgattaaaggt
aaaagaaagcaggtggcatatcaacgaatccgtgatgaagtggctcggggggtcggggtccctgctgacc
ctgaacctcctgagccggtggaggttgagatcccatgggtggtctcgccgcctagggggggattgtaagg
gcgccgggaatttccggtgaggatctcgcccggctgctgcatcaatgcggtttttcggcgggcgagatcg
ggccaaatctcccccggggccgcgctcgcaacgctcctactccggagtgggagctgaacaacagagtcaa
gcgtaagcgtcagaagtttgctcttacgcagaccctctactacgaggataagtccaaagcgcttgacttc
ataatggatgggagaaatccattcgaggcgggcgagccctctcgtgcggtgagggatgagtggagggagt
attttgagacacgtgtggacctgggcagggtggcggatggtgcttgcttgagggtcggtcagcccgtgga
cagatttcctgccgtgggtgacgacataacactggcggagctcgagaatgcgttgaggagcaccccctct
aagaccgcaaagggggtggacggtgtggggttggaggagttaaagcgagtgcctagaagaacccttttta
acatcctcaacggactttggacccacgtcccggagtcgttgtacaaagggagaatcactctaatccctaa
gaagtcgctaccggagttggctggagattttagacctatttgcgtgctccctgtggtggttagactgcta
cataggatactcgcaaaacggcttgcgattgtccaacataccgaattccaagccggtttccagtctggca
ggtctacttcggagaacatcttccttctgaggaccattttggagtcgttgcctgcggggaaggagtctat
gtatatagcactccttgacttccgtaaggcctttgactcggtcaaccacacggtgttgtgtgggctgttg
agggatttgggcttgcccgagcgcctgaccgggtacgtagagtccatctaccggtcagtgcatctgactc
tcggtgacgactggttcgttcaggggcgtggagtgttacagggtgatcccatatccccgttcctgttcaa
cctgatgatcgattacatcctgagtggcactcaggcgggagtaggtgtcggggtcggagagcgcttagtt
tccagcctggcatacgctgatgaccttgccctgcttgcgtcctctaggaggggtttgaatgcgaatctgg
agtcggtcctcgcccgggcacgctcggtcaatctggcacttggaattaacaagtgcgcgacgatcggcaa
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ccggtatatcgttggaacaacatatacaagtacttggggatagaaacctctccgggggccgcggcccgct
ggagtgtcactggattgagaaaccgtctaagtaagctcgagtccgcgtgtttaaagcctcagcagagaat
gcacctgctcaggtgttaccttcttcctgggctgtattacggtttgatacaccagggaatctcggttggc
ctgcttcgaagtgctgataagcaggtcagagccgcagcccggaagatccttcaccttccgggggacgtcc
ccgtcccgttgttcaatgaaaagtcggcgctcggcgggctggggctcgtcgagctagaagtcaaggtgcc
ggagctgttagacaagatcagaactggactgttggggcggggcggcctctggagggtggtggctgatcgg
attaagatcccgatctcgaatagggaaagacggctccttgtcacggagttttgtgacggccgaggctttt
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ttacgtagaggcagtcaagatcaggttgggcgttgtgtcgaccaaggagagggcagcaaggggaaggaac
gtgccccttcaccaagtaacatgtgacctaggctgcccgagggtggagtcgctggggcatatcctgcagg
agtgcccttcgatttccaacctccgaatctcccggcacaacgcattggcctcaaggatacgccgggctct
cgcgggtaaggggtggagcacggtcgaagaaccgactattccaacgataccaggaaaccgacgccccgac
ctggtggcctggcgtggagaaagggctatggtctttgatacggccattgcgcgagctcacgcggcggttt
tgaacgaggtgttcgataggaaggttgttaagtataatacacctgaaatacatcagtgggttattggacg
ttcgcgggcaagagtggttgaggtctcggcgctggtcctcaactggcgtggggatatggtggagaagtcc
tatgttatgctgagggctctcgggttaacctcggctattaaattcatggaggtggcttgtatggaggggt
ctgttagatccctaaggtttttcaaacaagcctccggcagatggggttgaggcgtgaatgtggttcgtcg
ttcagttgaacgggggtggaagtctgtccaaagactctcgcccggcatgaacccgcccatgtcgttatcg
tgtacataacagattaacgttccctccggtgggacggtttactgttccgccgggggtggagattgctttt
gtacatctcccctctattaagtttctgcggtggtggaggcggggaattatttaaaaaaaaaaaaaaaa
>R2_FA   Forficula auricularia retrotransposon R2, complete sequence.
tagtccaaaagccttgtcatcttaggatgacgcgcaggtttttgagatgtatatttttatagtagtagta
aaatacgacttgttaaattcttaagataaagagtcatagtagcaagtgaagaccttttcgtggttcctgt
cataagtaccctacggggaaaccaacttcacccctgcgaacatggagcttagaggttaccagcctcctcg
ctcgtcaattagcttggtcccagatcaataaaccagcctcggataaggacggattcaccgaatatcgtta
gaccctctggttcaacgacgaccatgcaaagatgcaccacgtcagacttgactttctcccaatgtagatt
tcctcattgtaaattcagaagaccatctcttactggtgtcagggttcatgaacaaagatctcacaaggcc
ttttttgacagactgcaggctgaagtaattcgaaatcagacgtcaaaaaagaaaccgagatggaccgaag
aagagaagaacctgttagcacttgcgcaggcgaatctcataatcgaagaagaaactaatattatcgatga
cttggtctccaagttcacatatagaaccaaagatgcccttaagagccaaatcaggaaacccgaacacaaa
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ccatagctactgatccgttgcaagtctcttgcaacttcaaggacagagcaaaagactacatcgacacatt
agagcccataacttcaactaaattctatttagacgagttagaggctctgtgtgacaatatttgtatatgg
ccgactaggctacttatcacaacagtggagtcttacatacgaaaattgtttaaaacaacaagtacgttga
agccagcacagaagttacataatccttcaaacaggaatcttccaaagcgccagctaagacgtatggagta
tggtaagacgcagaagctgtggaaaaagaacccgtgtcgtgccataaaaacaattattgacgataaggac
tgtaagtcgccacccgaaagggaggcgatgacgcaatactggaagacaacgttttccagtaaaaagcgga
catgtccccagtatgagcctcgcgaaagtaccaaaacccagttgtgggaaccggttacaatcgaggagct
tcattgctgccaccttgaaatgacaaccagcccagggcctgacgggatcactgttagacagctttacctc
gttccggagcaattgcttgtcagaatattaaatctcctaatggcctgtggcaaaatgcctgatagcttct
tggaatccaaaaccactctgattccaaagaagcccaactctactgaacccggcgattttcgcccaatcac
agttcagtcagtgttggtcaggcaactgaataaaatcctagccgccagagtagcgcaacacatcccacta
gacgaacgtcaacggggatttagaccagtagacggagtcgctcacaacatcttcgaattagacatgatac
ttaggtgtcatcgatctgaattccgcgatctccgacttgcctccctcgacatagcgaaggcattcgactc
cattacacataacaccattgaggataccatggaagtaaggggtttccctaaacccatgattaactacata
atggcttgttatcgccgcagtaaaacgagattcacctttaatggatggatctcagatactgtgaaaccca
cttgtggggttaaacagggtgaccccttgtcaccaatactgtttaatctagtaatggacagaatgatccg
gaagctaccgaaggaggtaggagtcaatgtaggcagtaagcactataatggtcttacatttgccgacgac
ctactgctcttcgcgactactcctgaaggcttgcaatcctcaattgacattgtccacctcttcctcctgg
aatgtggactattgatcaacaagcaaaaatcctttgtccttacggtcaaagcatacccaaagctcaagaa
gacggcggtcatcgtcacagagaagtatatgttagaccgtcatattcttcccgctattgatagagagaag
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catcctccctagctgttatcacatcctaacgctaggaggatcgaacctaagtctgctaaagaaaatcgat
ttgatggtaagagctgcgggtaggaaatggtgctgcctgccaaaggacacgcccaacgcatattttcatg
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aaaattagactctccgacaatggctctaacattgattgtcaagccaagctttggcaattctgggcggacc
gattgtataagtccgtggacggctctgccctaatcgaatccagtaaagtaccacaacaacatcggtgggc
tacaggtggtagcagatttttgacgggacgggattttatcaactcaattaaattgagaataaataccctg
ccgacactatctaggacgctacggggtcgtgaaggcaaccgaatgtgcagaggtgggtgctacaatgtag
agacgttacatcatgtcctacaggtatgtcaccgaacgaacggaacacgagttaaacgacataacgccat
caggcagtacattgcgcggggtgctgctgtcaaatttgacacagtcgagagagagccccgtataaagtct
gcgtctggtgcagttaacatcccggacctagtggcttgtaacagcgatgaagtggttgtgatagataccc
aaatcgtctgggaccaggccaacctggatgaagctcaccaagccaaagcggagaagtatgctcacttaag
tgacatacttaagcataaatatagtagagatagggtaaagtttacctctgtaacgctctccttcagaggc
ttatggagtaaacaatcgctgaaggaactgactgacctgggaattgtcaattccaaagacattcaaatca
tttctaccagagctataataggaggtattgcatcatttaggatgtttaattcaacaacctcagtaaattc
agtaaattcctttctagaaatcgcattgggataggatgatagcgcacctggtcatcgtctctctcagctg
ctcacttgctgttctaagtgataataccgttgtttttttagtgggtattcttttacgctttcgtaggagc
gagtcccacactcttggagcaatccggggtagtgcctaaacgcatttcttcaacgtaaaaaaaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaa
>R1A_SS   partial sequence.
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tctgtcgggaagacctggaaaactgggccactgagaacaacttggaattcaacagggagaagactggact
tcttttccactcttggagacctgttcttcgaccgccagtcctacggtttggtggtgttgatcttgttccc
agtaccggtgtcaggtacttaggcatcattgtggatgtgaaatttgactggctggctcatgttcgctttt
tagccggtaaagtcaagcggatggccaatcggatttcagtggttgtgggtgcgaattgggggattaagcc
tctcgttttgcggactttgtatctgcgtgccattttgcctatgcttctgtatggtgcacggatttggggc
ctgagagcgggaagagttttcatgcagaagagggtaaatgccttgccccgcttcttgctgttgaatatcg
ctaggacttaccgcacggtgtcgacggaggcgttgtatgtcctatgtgggttacctcttctggctattgt
cgctgaagagaccgctctgcactatgctagactctctggtccggactattgtcgtgatactcctgttgct
gaatggactcaccctgccgaccgtgttgccctaccggtgggaacgtatgagaccatggatgccaccaggc
ttcagctcttcactgacgctcgcgacgtgagggcagaaccgcatcgggcttcgtcatttatgacaacggg
gttcaaattgatcactctagtgttcgcctgggtgacggtaattctgtctttcagtctgaggttctagcta
tttggtttgccgttatggccattcggcggttggcggtggatgaggcttctcttttttctgactctttgtc
ggcccttacagccatcagtggcagcaacccggtggatgctctggtcaggcggacgagggtggccgttgac
gaactgtgcaccacctgttctcttcacctgggttgggtcaaggcccatgtcgggatcgccgggaatgagg
aggctgaccgtttcgctaaactcgctctggacaaggatattgagcatcggaagttgctaccaaggtcgca
ctctagcctgattaagcagaggactatcttctttcagtggcaggccctgtgggaggggcacaaggacggg
cggccggtcttcgccctcttcccgaaggtcagctcgaggggtgccttatttggccggaaaatgatgcagg
tcataaccgagcatggtaattttgccaagtatctacaccgatttgctttgatggagtcacctgcttgtcg
ctgtgggggtggtgaggagtccgtggcccatatcctgcgtgagtgcgatctgccttttcgtgctgctgca
agatctcgtttccttcgcgagatggttccgcgtgggctcacgtgggcggatatggatggttcctggtgcc
gtgacgaatttgctactcactttgagcgttttgttaatgacgtcatcagtgatcctttcacctaa
>R1B_SS   partial sequence.
gcgtttgccgatgacacggctattatcatcgaggagacttccattaagaagatcgaagacagctggcaag
aggcggaaaggagagtgcagcggtgggcaacaaggaataaaatcgtttttaatgaaaacaagacggaggc
cattttcttcccagccaaacatgccaaaaaggtaccaattatcagatttggtctgaacctggtaggtata
aaagagtcacttcgttacttaggtgtgtatctcgataagagtcttttgtggagggtacacttacaggtcg
tacagggcaaagttgggcgaatcgcactgaaaatgcgtcaggttgtgggcacacattggggcattgacca
aatgaccatgcgagtgctgtataaacgagctctgcttcctctggtcatctacggctgtgagatatgggga
gagtgcgcacgcaagaagtggggagtgaaacgacttgaacaaatccagcgacccctccttttggggggtg
gtaaaagcgtgtcgaactacctccacacacgccttacaagttttggcggggctccccccactcagtgttg
agataattgcgcgaaggcaacattatgcccgcttgggggctgacgactatgaaagccatatcccggtgtg
cgactgggtgcatccagcacacatagaggaagaagcagttgggacatacccacttgaaattgaggcgagg
acagccctctttacagatgggtcaaagactgaggacggtgtaggttatgcggtggtggtgatggaagggg
gagaggaggtgcgaactcatacgggttgcctgccgagctactgctctatcgcccaagcagagatgagggc
tatttattggggctcttcagttttggagtgattgtggaaatgggccggcctgtctgtgctctgattcaag
atcgtctcttcaacatatcgctaacggtcgccagggagatgcaacagtcatggcagcggacgcccttcaa
cgctgccgagagcaacagagggcggtctccctctcctggattaaggcacacagcgggcaggccggcaacg
aacgggcggacgagttggcaagacaggctgcgaagaacgacctgtcgacaggtgaagaacatgttttgag
accgaaggcctactcgagggatatcttgagaaatgaagtgcgtgcgttatggcaacaacagtgggcaatt
tcgataaaaggacgttggacttttgaggttctcccacaggtgtcgcagtcgccgccggtgcttacaagca
agatggtgcagctcctaaccaatcatgggaactttgcgcagtatcgaagcaggttccggcttacagagga
agatggcgtctgtatctgcaaacaagggcaggagacagcgcacgacgtcctggtggaatgtggcctgcca
cacagagcccgggcccgttctcggatcgagcaaatggctgtggtacagggtgtccagacgtggcagccag
agtgtatggaatag
>SR2A   Schistosoma mansoni SR2 subfamily A non-LTR retrotransposon.
ttctcgctcacactagaagcaagacaatttacactattattattattattaccattattattattattat
tactattattattattattactattatttactacgtcgctttttcactccctttattctcaaattgtgta
tccttcctttccaacttatgcaggagctcgcccatggtggaaaatctgtcctatctaaacgatctccagt
cactgtctggttgaaagtgaatgcttccaccgattatgaatactgaagcagtctttctgaaaccgcgtac
accgttcaagctggcttccttcaacgttcgcacactaatgcattatcagacaacagatggggctggctat
gtctttggaaggtcttaatgttgatgtttgttgtctatccgagacctgtattcaagactctagtgaagta
ctacaaattcgctctccatctgtctcctcgaaaagcttgtttcacgtgcgcttatccggggaccctgtgg
catcttcgtctggtcttgctggcgttggtgtcgcactaagcgctagggctgaggcagcacta
>SR2B   Schistosoma mansoni SR2 subfamily A non-LTR retrotransposon.
gtaaactggctgcaacatctgttgcaagtaagtatcgagcggagctagcctctaggctagctaccacccc
accgaaaagtatagatgagcattggttgcatcttcacgacgccatgaaaatggcgagtaaagtcgcttgt
ggcttcgcgaaacgtcccgcttacaagcactgggtttcttctggctccttacaactgatcgaagcccgtc
ggtctactccgggtgaccgtgagtttgaccacaaacgaaggctgttacgtaatgaaatcgggcaaagctt
gcgtaaggaccgggaagcctggtggtcggagcgtgctaatgagatggaagcagcagctgcatctggtaac
tgccggaagctcttccaactcatccgagccactggcagcaagaagtctggtgtgagtgaaacaatctgtg
aggatgacgggatgccaatcactaacatctgtcgacgtcttggacgatgggcggaattcttcgaagggca
gttcaactggcatgctgctccggcaacatcaaccagcttgtccttccccccatggccggtgacgactgat
ccaccaaacgaggcggaagtccgcaaggaactccaactcttgaaacgttacaaatcaccgggcccagatg
acttacacccagcactttttaaagatggtggtgactttctggctaaggaactgactgtgttgtttggaaa
ggtttgggagcaagaaagtgttccaacatcatggaatgagtcgatagtcgtccctatctttaaaaagggt
tcacgttgttcctgtaacaactatcgggggataagtctactttcgattgcgtccaaactattggcttcta
tcattcttcgtaggttgtttaaaacccgagaacgattgactcgcgaggagcaggctggttttcgttctgg
tcgaggatgcattgatcacatcttcaccctctgccaaatgttagaacaccgtcatacttatcgcaggcca
acaatcgtagtgtttcttgatatcagggctgccttcgattcgttggacaggactgttctctgggattgtc
tattgaagaagggtgtgcctgagaagttcattaacatcttaaaggccctgtatacgaacacctcaggcag
agtgagggcatacaaccacctttctcccttgttccattcgagcagtggggttaggcagggttgcccgatc
tcaccattcctcttcaactttgccatcgacgacatcctggaaacagctctgatggatgtaagtaatggca
gtgtggatatgttgcctggagaacgacttctcgaccttgagtatgcggatgatattgtcttactgtgcga
taatgcccaaggcatgcaatccgcacttaatcagttggcaatcagtgtccgcaggtacggcatgtgcttt
gcaccctccaagtgaaaagtactcctacaagactggcaggattctcatcctgtactcaccctggatggtg
agcagattgaagtagttgagaagttcgtgtatctaggcagctatataagtgctggtggtggcgtgagtga
tgagattgatgcacgtataatgaaagccagagcggcttatgccaatctgggccatctctggcgccttcgt
gatgttagtctggctgtaaaaggtcggatctacaacgcgtcggtaagagcagttttgctttatgcttacg
agacctggcctcttcaagttgagcatgttagatgactctctgtgtctcatcatcattgtctttgaagcat
tgctgacattcagtggtcgggtccagtggcgacaccatgttggcaatgcagagattcggcaacgtgtgtt
cgggcacagcaacgataactcaattggtgtcactaacttgaaacactgacttcagtggattggacatgtc
ctacaaatgtcgtcccagagaattccacattagacattatttgccaacgctagggccggttgaaaagaac
cgagaggtggtcagtgtatgacatggtgtcgtgttatgaaagaaagttatacaggactggtttccgttgg
tcattcacaactccctgattggggtcctagagacggtacaacacagtggcttgaaatattatcagacata
gttcagaatagaagccagtggcgatcctgctgcaaccgtcttttactttctacataaagagtggttctaa
ctttcttaactgaaagtgtcttctggttgtacattttagtccgcgttatcttttcatcctttctcttcct
actttcattattttgtgtggcgcatatgtatctggtgcccttttgtaccaatatatatgtgtttaaataa
ataaataaataataaaatcatatataatatgatttaatcattctcatatttttcaatacactattttata
tatgtattatttatttatc
>SKIPPER   partial cds.
[encoded data, 7098 characters]
>AGM1   Anopheles gambiae Moose LTR retrotransposon, complete sequence.
[encoded data, 6035 characters]
ataaatgcttagcacacacaaaccgtagacagg
>LDT1   transcriptase genes, complete cds.
[encoded data, 5751 characters]
accacaa
>HOMER   complete cds.
cagagatctgcaacggacacacaatttccgtgcacactcgaacacttacccaaaaccggcttgtatcgct
ttctttgaacgagcagaaggattgctcgttagcgactgtgcgcacgcgaacgtgctgatcacaacactcg
agtgtcgtgcatacgtgttcgtttgggttcgggtgttttgcgaatcaatatgttcgagtgtccgagtgta
ggctcgagtgtccgagtttaggctcgagtgtgcaaagcattttttgtttatgtataatcgttagtacagt
tgattaatttgctttgtgagtgttaggaattttatatgatacatattacatgatatatattgaaaataat
ggccgaaaaagaagattctattggttgcaaaattgcgaatggcagttacagcttgtctggtaagcgcaaa
ggccgaagtttcgtatggaatattttatcagaaattttgaaaccggacggaactttactggaaggttttg
tttactgccgcacttgcttaaaagtattgaaatattataatggtcagacgtctaacctaattcgtcaccc
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aaaaaatttacatcctgggttgttgaagactgccgaccattttcggttgtgcaaggctcaggctttataa
aacttgtgaaattcttcataaagataggtgcatcgtatggcgaacacgtcgatgtggaggatttgttacc
gagcgcaacaacaatttcccgcaatgttcaaaaatgtgcaaatgaaaaaaaagaagaacttaaagaagaa
ataaataatattgtgagcagcggtggagcttcagccacaatcgacatgtggacggataactatgtgaagc
ggaactttttaggagttaccttccactaccaaaaagacttgaaattcttcgacttggttttgggaatgaa
atctatgaattatgaaagttcttcgggtgacaatgttcttaataaacttagcagtatgtttaaagaatat
ggtgttcaaaatatgagccaaattaaattcattactgacagaggaagtaatatggttaaagctttaaaac
aaaatatacgtcttaactgcagtagccatctattttccaatgtattggacaaatcattcgaggagacaga
agagcttacagatgtgttagcttcttgtaaaaaaattgttaaatattttaagaaagcaaatttacagcat
cttctacccacttcattgaaatcccaatgtcctactcggtggaattctaattatggaatgattaaatcca
taattgacaattggtttgaaattaacaatataatgactgataatgaacaaagccaacgattattacacgt
aaatgtatccattcttaaagttttggtttcaatgtgcaaagattttgaaactgtattcaataaattacaa
ctttgcagttctccatcgctatgctacgttcttccgtccattttaaaaataaaaaacatttgtgaattta
ataatagtgatatagctgcaatttcagtcttaaaggagaatataagaaaaaaaattgaggaaatatgggt
tgtcaatttaagtatatggcataaggttgcaacttttttatacccacctgctataaatatgcagccaaat
gatttggatgatataaaaaatttttgcatctctcaaattcaaaataatgcaatatcagcaccaacttcag
caacatctgcgggaaacgattccttaagcccaaccgccatctcacctactttgacaacgcatttttcttt
caatgaaagtaaccaaatagatcaaagccattcttcttctttatgttcaaaaactggaggcgatacattc
tttttcacttatttggttaaacgaaccaccccacaagccacagaaaagcctgaagatgaagttgagagat
atagcagagaagaggtagagatgactgaaaattttaatttgatggagtggtggcaaagtaatcagagtaa
atacccccatttatcaaagtttgcattgcagattcatgcaatcccagccagcagtgcagctgcggagaga
tctttttctttagctggcaacttaattactgaaaaacgtaacagaatagcgccaggctctgttgacagtt
tgctgttcttaaatacatattataaaaactataatgcttaatggttgggagttatatctaaagtatgcgt
gcaatgatagttttataaacatattttcctttatttatatttaatttcaagagtgataaaaagcatggaa
tgcgttttttttaatgattgaatgattgaaatatcttttgtttatgcgaagactgatttaataaaagtat
attgaagaatgaaaacagaagtttttataattatataagcatatttgtcgccaagaggtttggcgggaca
ggttattgaaaacgtggtcaatacccccaaaagtggacgtatgggcatcctactctaggttggatatttt
cattcatttaaaaagtattataatctgcaataattcagaatcacgatcacgcaaacaaacaaagagtgtg
aaactttgcattatacacttcagaactcaaacgcattttgtacggacattcatcttaaaattattttaat
ttcgtatgacacttttagcaagcttaggcagctaagatatatacatttatatatttacatatatattcct
tgcgctcgctatgattaggaataagcgaaatcttaaatttaataaacttatactagcaaaaatcaaaata
tcattgctcatataaattcgtatataaaatgtatgctacaattactatatagtagtccaaaaatatgaat
tcttatttttcacagaaatacttttgctaaaaaaggatctttttcttttcttatttttcccagaaataca
tttgtaaaaggatcgtaatccttttttattttcctcataaaagatttaaacagttcaagagctcaaaaca
tgcgctacatcagctacctactaaatttttcaatagctcaaagcatgcgctacatcagctcgaacctacc
taccctacgcctttgcgcaaatgattatcttatgataacaaatgcccacatatagatttggcaatggcaa
tagcaatagatttgacagttagcaagacatagattttatcctgtcgagatgccccgtaagtaagtatgaa
tgtacatatatctatactagccactctctttattgattggtttttcccaaaacacaaaatgcagttgcag
tcaagtcacactgcttggaaacacacgtatgcatgtaaaaaagcaactatcattattcttctctgattct
taactgggtcttatgttatggttatgcaactatatttttaattttaaaatgcgtcattcctttgatacat
gcatacatatagtttaaatgctgtatttcaatgatattggctgttaaagtgtatacagcattaataattt
ctcatatttttgctcagaaaaatgtgatacacttcttctacatccgtgttctgtccgagtatccgtgcaa
tagttgaacaaatttcgggttagcttcgggtgtcgagtgtggacactcgcttgtgatcgttttgaagaga
gtatgatcgaacagactcgaacacacagaaagcagctgccgggtgtgccactcgatcgaacccattgctg
ccgagtgtggcgctcgctcgtgctcgatttttaatgagggtgatcgaacatgttcgaacacacccaatgc
agctctctg
>ANM4   complete sequence.
atccccgggaaattctcgatcaccacggccatagactgcaccacaataccgagaagagtcgcaggtgcgt
tggcagcttgttttagtgggaagggtgagggagaagaggaagaagggataaggagggatataggtttcca
gcgtggcgttaaaaatgtaaagaaaattctttatttttcataacataataataagtctttacctatgaaa
ttgccgttctgcagtactggcctctcaaatcaaaataatttttgtttggctaacaattctaaattcaaat
taattttattttaaaaacatggaattcttttttccaaaattagtcatttgtttattgattactgttacat
tttcatcgcattttcaatcttttttgtcgtcatggatacgttaaaaattcgaataattatggaatatgag
taccgtcgtggcagcaacgcggcacaagaggcacgcaacatgtcattgacgtttacggagctaacactac
aaaccaacgcacaacttgttattggtttgctcgctttccgttttgggaatttcgacctgaaaaatgaacc
tcggggtcgtccgaagactatggtcgacaatgacgaattaaaggcgattgtggaagctgatgatacacaa
tctacggctaaattagcagcagctttcgacgttagcgtcaaaacaatattggtctatttgcgtgaaattg
gcaagggtaaaaaagctttacaggatgggtgctccacgaacttcaatgattcgccagcgcgaagtacgcg
tcgagacgtgccttgcactactcaacagacacacaaatgaaggaattttgaaccgcattgttacctgcga
tgaaaaatggactctgtttgataactgcaagcactcagcaagttggttggatcctgttcagcacctaaat
aatgccctaaacgagaacttactcctagaaatctgatggtcactgtttggtggtgtagcgccggtgtgat
tcatcacagcttcttaccaaacgtggtgagcattactgctgatatgtactgtgaagaactgaacccaatg
atggagaagctggcacgtctccaaccagcattggtctaaaggtctctccgctgttcttgcaagacaacgc
acgacctcatactgcacagcagacggtgtctaaattgcaagaactggggttggaagttctccgtcatccg
cccttactcacctacagaatactactttttccagaatttggacaactccttggcgggaaaatgaattcaa
tacccgagaggcagacaaaatgcctttgaaagaatttgttgcctcccgttcagctgatttctttaagaag
gacatcaataaactgccactgcgttggcgaagatgcattgattgcttaggtgatttcttcgattaataca
aaaaaaattacatgaataaaattcgtttaaatttttcatatacaacggcaatttcatagataaagaccta
tagataatgttacatgaaacgcaatatgtttactaatataccaaattatgcttatgtgtagtaaaagtaa
aaacaataaatattatgtaacaacatattaatttagatttttacatatccccattcccccattatgtatc
ttttcaactgttttccattttttttttattgtagcacggcaaaattactgcactatgcctgatgataagc
acagtgcaatccaaatataatagccgaccacccgattccccacactatccatcgcccggtcgtccactat
ccccccggggctgggaaaaacccggaaattgccagggggaatttccccaaaaaccacaaccccccaaaaa
aaaaaaaaacccctttttggggttttccccaatacattggtggttgcaaccatcaggctgttgaa
>DIRS1   Slime mold (D.discoideum) transposon DIRS-1, complete, clone SB41.
[encoded data, 7100 characters]
ttaaatatatatatatatattagtcccatcccacccgcccttagtcggaattc
>TEC2B   region.
tagagggataataatattgaaacaaattaattaataattataattataaatattgaaaaaattatttcca
aactatcctttctaacttaccctcttccactcctaactattctctattaccaaatgtgatgatattaact
ataatcatgtctaatagctgattaacttcaactatgtttcaaacattaaatacccttctaaatacctaaa
ttctacccaaactataaggaaatatcacatttagactataaattcttcactggttcgcctgcggcttgtt
aatttactctcaccccagaccccctacagtagcgtagtaaaggcccaccaacttcattttagaggcttta
gtatcctctgaatatggccttagatcctatgtctaacacctacattggatacaaggcaaagtatatggca
ttctgaggacttatagtaaatttcgattttaatcttaaatttaataattaatctaaattagactacttta
aaatagggagatttgcctattttcaactcatcataactactaaggcagaactaactaggagctgtcagtt
gcagaatggtcttgcccttgccaacttaacagactgacaccattagacatcttgtcctctggcaatcttt
gaattattagatcatatggccgagtcctcagtggactctcccttttcaattcaaacagtgaaattctagc
taatt
>TBE2   Oxytricha fallax transposon TBE2.
caaaaccccaaaacccctacagtagtttgattgagtttttgattgatgaaagtagactattttcgcatgc
tttattagggttttaatagggttatgtaggggtttaatgtttaaatattagtaatttaagtgagtataac
aagcgagtttttaaaatatttcacacaaacataagcttagagtcatgtggcagttctctgaattttatct
tccttagtttatgtttgatt
>TBE1   micronuclear clone 123K1.
[encoded data, 4118 characters]
gggttttggggttttg
>SIRE   SIRE repetitive element (a consensus).
aagaaaacattgaagcaattaactaacgaacctttttycctaacttgtttggtttccatagataatttca
ggatccggccagctgcccggaagattattctaggagcttgtgaaaagaatgatcgcgggagagctggcta
acttaattaatgtatgtgtatatcctgataaatgaatgcattctttatgatacttttctaccgtatgaat
cttttgggaagaacgcgactttgtaggggcagggarccgatagaggccagataatattttatttttattt
tgccatcccacccacccccttttgattcccaccaca
>BACSAT   Bacillus satellite DNA (a consensus).
agatctgtatttgttgatttatttcatttccatttgtatcgattcagcttattttggttattttacatta
atatgatcaagtagattccatttccactcatttcacttatatccttttatttatagtgttataattcatg
catttaaacaggttaattcggttctttaaataacacttatttcattataaatgggttattttgatgcatt
atattgatttttaacttcattttatttgttttaacatatttgggtagaaatcatttcatttctattgtaa
caagtgtttttgtttggcgaatcaggtttccgaatg
>TDD_DD   junction.
tctagaatacatcaaaaaagcaaaagatctgaaaancttatcagcaaaagaccataataacttcaaagat
cctaagatccttctcacttcaacgatcaagctaagaaaaacaacagctaattactattgtattccagaat
catctctcccaaatattatatcttttgatcaattcatatgattaaaataacccttcagcttaaatgataa
gcctttaaataaatattaaataaaactcgtattaacacagatggacatatatcaatcttgttaatccaat
attaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaacatatccatcatcaatctaacatcaactacattcaatctatct
actctacacactaattccttcaatccttggattaggaataagaatagatctgaataaacgagaaagaaaa
aaaaaaaaaaaataaaaataaaaataaaaaatatttttatataaacacataattaaaaaaaaaataataa
aaataatataaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
>BMC1   Non-LTR retrotransposon BMC1 DNA, complete sequence.
[encoded data, 5112 characters]
aggcctccgggccaccagtaatatctcaatcataaaaaaaaaaaaaaaaaa
>TRE3A   non-LTR retrotransposon TRE3-A, complete sequence.
[encoded data, 5318 characters]
>TREB   non-LTR retrotransposon TRE3-B, complete sequence.
[encoded data, 5325 characters]
taattgtatactacaatagtttatttatatcaaaaaaaaaaa
>TDD3   non-LTR retrotransposon Tdd-3, complete sequence.
[encoded data, 5254 characters]
cacagatggacatatatcaatcttgttaatccaatatt
>R2A_TM   partial cds.
gcctacgcggacgatatcatcctgcttgcagataacgtcgagactgcgcaaagacttctcaacgcctcca
caagattctttgaagaccgggggctcgacatcaaccccgcgaagtgcgagtctctagtgatgcgtactct
cccgtcaaagaagaaggtcttcactgtgacaactccgcaattctacgttaaggctgaaccgatcaagcca
atagaagttggaaaggcttttaaatatctggggcagcagttcacatgcacgggttcaaccaactgctcaa
ccaaagatctaagcgaacagctacttagaataaagaaggccccactgaagccccaacaaaaaataaacat
catcaaaacgtatctgatgccggcctacatccactcaatgcagaacccagccgtcaacaaaaagatatta
cgagaagtggataggaaaatcagaatggtcgttaaggggatactacatcttccactccatttgtccaaca
ccgcaatatatgccccggcgaaaatgggaggtctaggaatgttttccttttcaagaaagatccccatcat
tgtactaaaacggttaaacaacttaagccgtacttgctcgaacttccaccttgtgttgcgagaggccgcc
ccatgggtcaatagattaaagaaaatggtaaggccagacgtaacgacaaaagagcaagtggacagagcaa
atggggtggaacatgagggttcgtactacggcggcggtacgatgcaatgtcggaacgactctgcttcaaa
tacttggatcaacacccccccaaggtattggaccggatcggattacgtgaaagcggttcagctaagactg
aattgcctggccaccagaggccttccctataacccgccggaacaaagaagatgcagagcgggatgcgaca
gggttgaaagcctgtcgcacgtcttacagaaatgccctctaggacacacaatgaggatgagaaggcacaa
ttacatcgttaaaaggcttaagaccatggctctgaagaagggatggacggtggaggaggagccgatatgc
gatgcgcgcggtgtactgaggaagccagaccttatcctcagcaatgaagagacggccctagtagtggacg
ccatggtgtcctgggagtgccccagagaccttgcagagacattcgattgcaagaggctggtatatgacca
gcctgagtttaccagcgtactcgaatctaaataccatccaaggaatatcagagtactacccttcatcatc
ggcgcaagaggtatgtggtgcagacagagcaccgaaacactagaagcgatgaaggtgaacaatgtgagca
atcgaagggaactggtccatacaacactgagaggaagctggagtatacatcgagaatttacgaggagaag
ctgggaatag
>R2B_TM   partial cds.
gccttcgccgacgatttggtgctccttgctgacagtgccaaggacgccaataggctgttatcggaggcct
cgcagttctttgcggatcggggactcgaattgaacgttgccaagtgctgtgccttgtcaacaggtgtagt
tccgtccaaaaagaagtgttcagctcgacttagatcttattccaggctgaacggtgcccacatccgtcaa
gtggcgattggcgatgtcttcaagtatctgggcaatcacttcgctttcgatggcgttagtgacataagct
tggaggaactaaactctcaaattaataatttgatgaaagccccgttaaactctcaaattaataatttgat
gaaagccccgttaaagccttggcagaagttcaaaattctgaggcaaacatctgataccatcgggtggata
cactgccttcagagcccttctgtttcgaataaagtcctaagggaggctgacaggaaaattaagagagcgg
ttaaatcgattcttcacttaccggttactattgccgactcgtcgatctatgcaagccagcgcgatggtgg
tctcggggtcttctgcttctcaaggaagattcctgtcattcttcgctcgcggtgggagtcgctacaggag
atggctgatcccgcgcttggcgctgttctcctgcaatcggagagatgcatggatagagtctcgagactaa
ttaaagaggactggagatctgacagcgaaatcaagaacagttttaggcggagccttgagaattcttggtg
cgggggtggaatccatcaagtagggataatcaagcttgcaagtaaatatctgctgcacccccctgccttt
tggacaggaagggactatgtgtccacaattcagctgaggctgaacgcgcttccttccagaggtttaccat
ccaacccccccgaccagcgtatgtgtaggactggatgtggcagatctgagtccctatcacacatcttaca
gagatgtggattcgttcagggccatcgaatatcacgccacaaccatgtcgcaaggaaaattaggaggttg
gccgagtctaaggggtgggaagttagggaggagcctactatccgcaccaatgaacaggttttcaaaccgg
atctacttctgattcgcgataatgaattaatagtgtgcgatgtctccattaactgggaaggtccgtccca
ctttccacacactatcaggataaatttaataagtatgccactccaggtgttatccaatggctgcaacaac
gattttccccgacaaactgtcagattccttccctttatattgggtgctaggggatcttggtgtggcgaca
acaggagtttagttgacgcgcttgaactcacacagcgcaatatagaagatctaatacttacatgtctcac
tgggagccttatcatctataagagcttcatgaagtcggtctggaggaggactgtcgcgggtgactaa
>DEC1   DEC1 is a putative nonautonomous DNA transposon.
tacactgaccggcacaaaaaacgactcattatgatttcttaataaatgatcttgaaattactttgtgctt
atttttctttattatagttaaattgggatattttgaatgatcgggagtgccatggtcaccatggcaaccg
aatgttttgtttaaataaattataataataaatttgcgctacttccacgttgtgtttttgatggttgatt
tacgtgttaaaagatctaatgtgacaatacgagatactaactcaaaatgctgttcaaattttggcaattt
ttcataacataaaattttttctgaaaaattacttttatttttttttcactaaaattttatttgctgtgtt
taatgttttgtttgtcggatatctttgacaaagaataacttaaataacacttatcaatacaacatgatat
caaaaaaaaattctaagacaatgaattgcttaattatattaataaaattcaaagtgagtcgttttctgtg
ccggtcagtgta
>DEC2   DEC2 is a putative nonautonomous DNA transposon.
tacactcaccggcacaaaaagcgactcattatgatttctttaataaataatcttgtgcttattttttttt
tttataatagttaaattgagatattttcaaagatcgggagtgctatggtcaccatggcaaccgaattgtt
ttgtttaaataaattattgaaaagtttgcgctacttccatgttgtgttttggtcggttgttttacgtgtt
aaaatttttaatttgacaatacgagatactaattcaaaatactgttcaaattttgacaattttttgtaac
ataaaatttttttctaaaaaataacttatcatttttcattaaaatcttatttcctgtgttttaatgtttt
gtttgtcggatattttttggcaaagaataacttaaatagcacctactaatacaacatgataccaaatgaa
ttacttaaaattcaaaatgagtagactcttcaaacgatcattgtg
>TRE3C   TRE3C is a non-LTR retrotransposon - a consensus sequence.
[encoded data, 4819 characters]
>AACOPIA1_LTR   LTR retotransposon.
tgtggagaatgcatcggtgtaccccttcactactgcacgaatacccattcccaccattctggcaaccgtg
cactctttcgtgtacgacagctaggagaagagaaaaaaatgttttttttcagttcaaatctaacactcgc
cgcgtgcatacaaactttgtatttctttgcttaataaaaccatcgttaaagttatttccgcgtgtgttct
cgttattccgctggttctcccgaatcccccgatccgctgtgttgcctgtttctgctaaca
>AACOPIA1_I   LTR retotransposon.
[encoded data, 4118 characters]
aaactgggactggaggatccgcagtgaagcaggtaaccgctgaggaggag
>LYDIA_LTR   endogenous retrovirus.
tgttatatattaatagtccaggcagaccgcggattcagcagcagttaatatgcattcattattgtactac
atcagcaattacgcaagcaatgcttcgccgccgccctgtcgccggaatcagagctgacgctgcagttgtc
accgattgcatttacgtagtttcataataaaatcgttcattccatattcatacttcgaataggttagatt
aattagatctatgtaatttttatatttaattaaataagtttatagtaattttggttttttttcgatcctt
tggctgccgctaacgtaatt
>LYDIA_I   endogenous retrovirus.
[encoded data, 6106 characters]
cgttcgaaaatggtcgcagatctacgaggggagg
>MIMO   Mosquito DNA transposon "MIMO" - a consensus.
cagtagttgttcggtaactgggcgttgtttaactgggctgctttttaactgggcgctcgataactgggcc
gtagcccagttaaaaagcagacaaacgtcaaaaaaccaaaacaaaccgaaatgaccgaggggttaatgga
tgcaaaaatcatattcaataaataaaaaaacttttttcaaacttttgtttaatttcaagttacaattaaa
gaaaaatgaaaagtaagcattgtaaataaatttgagtaacttttatttttatatttcatctggaaaatat
tatgcatcggtggtcccctcgttatttttygttcagcccagttaacgagcagcattcggtgactgggcta
cgttctcagcccagttaccgaacaactactg
>TWIN   Twin SINE retroposons from the Culex pipiens mosquito - a consensus.
gccgagcttccgtggccgtgaggttacgggtttcgccttgtaagcggaaggtgatgggttcgattcctgt
ctggctcggcaaagtcagatcccttcaaagagtaaatatgctcactgggaatactgaccggtaggggatg
ggtttcgactagcggcgtgctggatttccaatccagaggtcgtgagttcgattctcgtaccgggatgatg
aagttttaaaaa
>MARINER_TF   Mariner sequence from tephiritid flies - a consensus.
ttggatgagtgcataagttcgtgcccgattccgctggatgccgtwcgaatcgtttgagagtggcgctcgt
gaaagaaatatatacatattatatatcgttggaaaggtgacagtccgaactgtaaatcaagcataaaata
acttcattttgatttgagttgcttagtgaaaagacgcatggaagatgracaacgaaaaagatcatatgcg
tcatattatgttatacgaattccgcaaaggaaaaacagtgggcgctgcaactaaagatattcgcgaagtt
tatttggaccgtgctccagcactccgcacagtaaagaaatggttcgcgaaatttcgttctggagatttta
acctcgaagatcaacctcgcagtggacggccttctgagcttgatgacgatgttctaaggactttagttgc
gaataactcacgtatttcgacggaagaggttgccagtgaattgaacgtcaacaaatcaactgcgtttcgt
cgtttaaaaaaggttgggtacactttgaagctcgatacatgggtgccacatcagttgagtgaaaaaaaca
aagtggaccgtatgtcaacagcaatttctttgcttcccggacggatcaaaaacgaaccttttttggatcg
gctcgtgactggtgatgaaaaatggatcctgtacaacaatgttcaacgcaaaagaacatggaaacaggca
cacgaaggggcggaaccgatgtcgaaaggtggattgcatccgatgaaggtactgctgtgcatttggtggg
atatccgaggcgtgatctattttgagctcttgccagctggagaaacgatcactgccaacaagtattgtca
gcaattggtcgaattgaagaaagcaattgatgaaaaacgtccgattttggccaatcgcaaaggagttctt
ttccatcatgacaacgccaggccacatgttgcaaaaccgaccctggccaaactgaaggagattgaattgg
gaaatcatgccgcatcccccatattcacccgacattgcaccttctgattattcatttgtttcgatcgctg
cagaacaatttgaatggaaaaaaatttaaaaatgtggaagacgtcaaaaaccaccttgacacctttttca
acgagaaaccgcgcgatttctatgaatcaggcatccgtaaattggttgaacgttgggagtggattgccga
acatgatggcgaatacataattgattaataaaagcgctttcttcaaaaaatttcaattttagtttgcact
tgaaatcgggcacgaacttatgcactcatccaa
>PONY_AA   Non-autonomous DNA transposon PONY - a consensus.
taccgttttgattcatattacggacacttaaggcctcagtgaagtataacccagcatagagcatacaaaa
taaatcattctgtatgattccttagcgctatcgagcgtcggaaacccttaactttcgaatggtgggtgaa
gaatacgcttccgcaacttgaataattttaaataaatcaaaatgtgtggccttttcatgattcttattcc
ggacgcttcctcacttttgcctcatattccggacactttgattcaaattccggacagctcatgaaaatca
ttaatagaacagtcaaatcattaattgaaatcgttaaaccactaaagagacgtctaargyagttgggcat
tataaattttcanagatatttatggaaaatgcttattaaaacgagcctcgaaagtgagaacttttgaacg
gcaaaaattgaaacatttcgtgtgaaatgtttcccatacaaagtagagtgtccggaatatgaagctgtcc
gtaatctgagccaaaacggta
>FEILAI_AA   Feilai family of SINE - a consensus.
ctggggccttccttagccgagtggttaragtccgcggctacaaagcaaagccatgctgaaggtgtctggg
ttcgattcccggtcggtccaggatcttttcgtaatggaaattttcttgacttcccngggcatagagtatc
atcgtacctgccacacgatatacgaatgcgaaaatggcaattttggcaragaaagctctcagttaataac
tgtggaagtgctcataagaacactaagctgagaagcaggctctgtcccagtggggacgtaatgccaagaa
gaagaagaa
